276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5058 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 493 aa  1027    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  39.27 
 
 		 539 aa  318  1e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  37.5 
 
 		 504 aa  287  2.9999999999999996e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  35.89 
 
 		 527 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  34.6 
 
 		 538 aa  256  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  35.36 
 
 		 502 aa  252  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  35.37 
 
 		 542 aa  250  5e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  31.48 
 
 		 537 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  33.03 
 
 		 539 aa  243  7.999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  33.94 
 
 		 537 aa  227  3e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  32.54 
 
 		 543 aa  217  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 513 aa  207  4e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  35.17 
 
 		 534 aa  193  7e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 538 aa  186  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  31.76 
 
 		 519 aa  179  1e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  33.05 
 
 		 515 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 529 aa  176  7e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 562 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 530 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 530 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 564 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 587 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 540 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  30.34 
 
 		 588 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.26 
 
 		 494 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 577 aa  116  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 575 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 483 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 477 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 487 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 473 aa  103  6e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.52 
 
 		 477 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 478 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 578 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 560 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 478 aa  99.8  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  26.34 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 476 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 488 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 498 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.7 
 
 		 461 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 476 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 491 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 506 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 504 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 502 aa  94  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.84 
 
 		 511 aa  93.6  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 486 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 510 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 479 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 570 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 466 aa  90.5  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.14 
 
 		 499 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 542 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  23.95 
 
 		 582 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 494 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 519 aa  89  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 479 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  22.98 
 
 		 522 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 509 aa  87.4  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 499 aa  87  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 527 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 507 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 493 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 511 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 480 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 452 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 549 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.31 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 466 aa  84  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  26.11 
 
 		 486 aa  83.2  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.36 
 
 		 507 aa  82.8  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 501 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 494 aa  82.8  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  25.81 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 491 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.2 
 
 		 498 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 464 aa  80.5  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 582 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 461 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 492 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 503 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 472 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  41.03 
 
 		 448 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 483 aa  77.8  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>