280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2892 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 624 aa  1276    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  33.28 
 
 		 565 aa  248  2e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  33.76 
 
 		 556 aa  239  8e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  33.17 
 
 		 561 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  31.86 
 
 		 555 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  32.19 
 
 		 537 aa  225  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  32.64 
 
 		 533 aa  220  7e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 548 aa  196  1e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  32.43 
 
 		 549 aa  196  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  31.5 
 
 		 557 aa  169  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 573 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  28.76 
 
 		 646 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 479 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  33 
 
 		 483 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 652 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.16 
 
 		 499 aa  113  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  33.58 
 
 		 604 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  33.95 
 
 		 520 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 500 aa  108  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  33.01 
 
 		 519 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 520 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 510 aa  107  8e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 502 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  33.62 
 
 		 470 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 481 aa  107  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  34.45 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  31.55 
 
 		 750 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 491 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.22 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  33.91 
 
 		 483 aa  101  5e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 514 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 522 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 486 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  35.05 
 
 		 511 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 544 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 506 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 460 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  32.17 
 
 		 493 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.03 
 
 		 490 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  34.36 
 
 		 664 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  32.2 
 
 		 494 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 477 aa  94.7  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  29.93 
 
 		 523 aa  94.4  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  31.73 
 
 		 519 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 511 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 598 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 499 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 541 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 534 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 601 aa  90.5  8e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 485 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 614 aa  90.1  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 603 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 506 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  31.67 
 
 		 612 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 522 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 514 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  31.45 
 
 		 499 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  31.97 
 
 		 488 aa  87.4  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.7 
 
 		 495 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 547 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  30.16 
 
 		 531 aa  85.9  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 549 aa  85.9  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 448 aa  85.1  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 456 aa  85.5  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 592 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 503 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  31.66 
 
 		 458 aa  83.2  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.3 
 
 		 503 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.71 
 
 		 494 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  30.8 
 
 		 667 aa  82.4  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 618 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 479 aa  82  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 480 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 574 aa  81.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 498 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 592 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 497 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 493 aa  80.5  0.00000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 509 aa  80.1  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  39.68 
 
 		 480 aa  80.5  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 521 aa  79.7  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 513 aa  79.3  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 582 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 527 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 491 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 579 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 529 aa  77.4  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>