More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0440 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 561 aa  1162    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  63.75 
 
 		 555 aa  730    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  44.98 
 
 		 537 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  44.16 
 
 		 556 aa  439  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  41.3 
 
 		 573 aa  377  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  40.18 
 
 		 549 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  38.96 
 
 		 533 aa  348  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  38.13 
 
 		 548 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  32.47 
 
 		 565 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  33.23 
 
 		 624 aa  244  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  32.05 
 
 		 509 aa  187  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  31.03 
 
 		 557 aa  182  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 542 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 652 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  28.03 
 
 		 646 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 476 aa  147  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  27.98 
 
 		 530 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 602 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 534 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 513 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.29 
 
 		 522 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 560 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 544 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 511 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 551 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 523 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 531 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  33.65 
 
 		 483 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  28.7 
 
 		 511 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 540 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 566 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 500 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 477 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 582 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 579 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 493 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 592 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 479 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 601 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 519 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 633 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 570 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 529 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 498 aa  103  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.37 
 
 		 498 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  28.12 
 
 		 750 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 514 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.13 
 
 		 481 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  39.01 
 
 		 494 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1260  RagB/SusD domain protein  31.73 
 
 		 685 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296024  normal  0.398588 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 549 aa  101  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 505 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 608 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 508 aa  100  8e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.07 
 
 		 486 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.16 
 
 		 490 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 541 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 582 aa  96.7  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  30.04 
 
 		 499 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 568 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 610 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 470 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 478 aa  94  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 499 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 448 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 480 aa  93.6  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  34.25 
 
 		 499 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 592 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 460 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 613 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 491 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 503 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 594 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  24.07 
 
 		 504 aa  91.3  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  31.38 
 
 		 479 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  36.79 
 
 		 494 aa  90.5  7e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31.67 
 
 		 506 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 576 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 481 aa  90.1  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 507 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  22.38 
 
 		 538 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  31.96 
 
 		 520 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 487 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 522 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  25.19 
 
 		 582 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 588 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 483 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 578 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 549 aa  88.2  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>