208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0794 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  65.19 
 
 		 646 aa  864    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 652 aa  1344    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  30.85 
 
 		 604 aa  217  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 555 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 573 aa  172  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 561 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 537 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 624 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 549 aa  116  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 542 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 574 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 565 aa  90.1  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.54 
 
 		 476 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  31.2 
 
 		 499 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.65 
 
 		 494 aa  80.9  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  31.19 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 539 aa  80.9  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  33.61 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 512 aa  77  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  29.11 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  30.41 
 
 		 491 aa  74.3  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 664 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 603 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 480 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 519 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  31.56 
 
 		 480 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  30.67 
 
 		 511 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  31.44 
 
 		 491 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  30.32 
 
 		 534 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  23.75 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  27.63 
 
 		 750 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 494 aa  69.7  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 540 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 503 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  36.13 
 
 		 602 aa  68.6  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 503 aa  67.8  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  29.29 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.22 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 484 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 506 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 502 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 613 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  23.29 
 
 		 509 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 493 aa  65.9  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 501 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 527 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 477 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 547 aa  65.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 582 aa  65.1  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 506 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 477 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  31.74 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 478 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 481 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 618 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 513 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 549 aa  62  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 633 aa  61.6  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 559 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  26.07 
 
 		 667 aa  60.8  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 466 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  29.96 
 
 		 537 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 539 aa  60.1  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 451 aa  58.9  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 486 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 492 aa  58.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 601 aa  58.2  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.14 
 
 		 511 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 541 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 521 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 464 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 521 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 540 aa  57  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 510 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 492 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 426 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  25.71 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 485 aa  56.6  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 498 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>