215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3126 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 537 aa  1118    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  68.09 
 
 		 539 aa  757    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 537 aa  243  9e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  33.94 
 
 		 493 aa  227  4e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  32.18 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 527 aa  204  3e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 542 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.75 
 
 		 502 aa  196  1e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  29.43 
 
 		 504 aa  193  6e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 539 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 538 aa  177  5e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 543 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 564 aa  169  9e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  32.46 
 
 		 515 aa  168  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 562 aa  164  5.0000000000000005e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 513 aa  153  5.9999999999999996e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  28.16 
 
 		 534 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 575 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  27.88 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 530 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 577 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  26.18 
 
 		 588 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 587 aa  123  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  24.79 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 498 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  33.04 
 
 		 530 aa  93.2  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 519 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 477 aa  90.1  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 579 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 520 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 521 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 555 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.64 
 
 		 480 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 494 aa  79.3  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  23.88 
 
 		 461 aa  78.2  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 506 aa  76.6  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 561 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 527 aa  76.3  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 531 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 484 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  24.1 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 548 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 510 aa  70.9  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  22.35 
 
 		 548 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.91 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  21.43 
 
 		 565 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 511 aa  70.5  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.56 
 
 		 499 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  23.57 
 
 		 532 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  35.21 
 
 		 487 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 464 aa  69.3  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 573 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 531 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3257  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00159706  normal  0.0650602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.62 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 582 aa  67.4  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 556 aa  67.4  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.88 
 
 		 486 aa  67.4  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 523 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  34.92 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 572 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 479 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  22.85 
 
 		 488 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  24.33 
 
 		 576 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 499 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 507 aa  64.3  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 469 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  38.84 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.88 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 483 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  23.26 
 
 		 540 aa  63.5  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  35.46 
 
 		 511 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2061  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 528 aa  63.5  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000559394  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 491 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  23.73 
 
 		 488 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 504 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 478 aa  60.8  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 601 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  22.1 
 
 		 603 aa  60.5  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  25.52 
 
 		 531 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  26.69 
 
 		 507 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.64 
 
 		 490 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 540 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>