139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5420 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  80.35 
 
 		 577 aa  960    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 575 aa  1195    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  65.49 
 
 		 578 aa  795    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 		 543 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 538 aa  223  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 537 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 539 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 538 aa  163  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  26.7 
 
 		 537 aa  147  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 539 aa  140  6e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 527 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 562 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  27.68 
 
 		 504 aa  120  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 515 aa  114  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  28.47 
 
 		 502 aa  103  9e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  23.44 
 
 		 588 aa  98.2  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 513 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 587 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 540 aa  92.8  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 555 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 499 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  22.74 
 
 		 520 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  31.5 
 
 		 534 aa  81.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  36.88 
 
 		 519 aa  81.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 529 aa  79  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 549 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 493 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 530 aa  74.3  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.76 
 
 		 499 aa  71.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  34.72 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.6 
 
 		 499 aa  66.6  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.89 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 486 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 483 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 592 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 530 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 565 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.44 
 
 		 498 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 579 aa  61.6  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 548 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  34.62 
 
 		 560 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  22.9 
 
 		 598 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 513 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 599 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  24.23 
 
 		 604 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  22.37 
 
 		 594 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 548 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  33.86 
 
 		 469 aa  55.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  32.03 
 
 		 574 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  22.45 
 
 		 486 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  36.09 
 
 		 490 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 520 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  35.42 
 
 		 561 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  35.05 
 
 		 492 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  23.16 
 
 		 502 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  21.46 
 
 		 490 aa  53.9  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 542 aa  53.9  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 531 aa  53.5  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 481 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  23.18 
 
 		 494 aa  53.5  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 497 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  32.33 
 
 		 566 aa  53.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 508 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  34.43 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  35.25 
 
 		 507 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 464 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 540 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  34.68 
 
 		 448 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  23.57 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 501 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  32.21 
 
 		 498 aa  51.2  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 594 aa  51.2  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 478 aa  51.2  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 478 aa  50.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 494 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 485 aa  50.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 506 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 579 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 541 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  30.87 
 
 		 523 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 601 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 601 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 582 aa  49.7  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  22.58 
 
 		 499 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 487 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 472 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  33.05 
 
 		 487 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  22.8 
 
 		 531 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  21.79 
 
 		 549 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 466 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  33.08 
 
 		 571 aa  48.5  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  23.66 
 
 		 556 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 504 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  24.59 
 
 		 588 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  37.3 
 
 		 466 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>