297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1301 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 571 aa  1177    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  50 
 
 		 584 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  50.52 
 
 		 564 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  39.83 
 
 		 568 aa  336  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  38.71 
 
 		 557 aa  335  1e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  38.91 
 
 		 565 aa  330  4e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  38.34 
 
 		 568 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  32.74 
 
 		 600 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  35.91 
 
 		 561 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  32.79 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  32.47 
 
 		 594 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  33.93 
 
 		 583 aa  251  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  35.06 
 
 		 555 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  32.42 
 
 		 599 aa  231  2e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  29.92 
 
 		 593 aa  229  8e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  31.8 
 
 		 582 aa  229  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  34.64 
 
 		 566 aa  219  7.999999999999999e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  32.38 
 
 		 620 aa  219  8.999999999999998e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 568 aa  213  5.999999999999999e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  33.39 
 
 		 559 aa  206  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 615 aa  200  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 531 aa  200  7.999999999999999e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 584 aa  197  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 540 aa  191  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  32.29 
 
 		 615 aa  186  1.0000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 629 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 623 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  30.88 
 
 		 529 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  29.69 
 
 		 626 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  31.62 
 
 		 587 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 581 aa  176  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 629 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 642 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 625 aa  170  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 673 aa  162  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 638 aa  162  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  27.4 
 
 		 630 aa  158  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  33.12 
 
 		 540 aa  157  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 579 aa  155  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  29.13 
 
 		 666 aa  153  8.999999999999999e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 527 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 638 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.91 
 
 		 511 aa  147  6e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 582 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 636 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 579 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 505 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 627 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  28.8 
 
 		 639 aa  135  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 588 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 576 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 557 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 541 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 499 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 607 aa  130  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 548 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  30.31 
 
 		 550 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.24 
 
 		 487 aa  123  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 476 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 617 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.56 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 522 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 631 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 499 aa  118  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 540 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 491 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 614 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 494 aa  115  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 633 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 494 aa  113  8.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 506 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 595 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 601 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 483 aa  106  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 520 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 487 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 576 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 478 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 496 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 510 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 511 aa  100  6e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  24.18 
 
 		 576 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 594 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25.64 
 
 		 612 aa  100  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 527 aa  99.4  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 486 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 480 aa  97.8  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 488 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  24.29 
 
 		 589 aa  97.4  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 504 aa  97.1  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.48 
 
 		 592 aa  97.1  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>