More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1498 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  61.54 
 
 		 549 aa  683    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 533 aa  1106    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  82.67 
 
 		 548 aa  935    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  38.96 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  39.34 
 
 		 537 aa  334  2e-90  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  38.42 
 
 		 556 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  37.7 
 
 		 555 aa  323  5e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  35.84 
 
 		 565 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  34.5 
 
 		 573 aa  267  4e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  32.61 
 
 		 604 aa  233  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  32.64 
 
 		 624 aa  220  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 509 aa  192  9e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  30.61 
 
 		 557 aa  180  4e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 602 aa  165  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  29.87 
 
 		 544 aa  143  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  25.9 
 
 		 652 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.91 
 
 		 479 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.85 
 
 		 490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  27.32 
 
 		 542 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  26.59 
 
 		 646 aa  125  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 477 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 507 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 560 aa  120  7e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 574 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.27 
 
 		 511 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 486 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 478 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 541 aa  114  6e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  31.45 
 
 		 473 aa  113  8.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.73 
 
 		 500 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 592 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 499 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 511 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.87 
 
 		 506 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 534 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 513 aa  109  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 470 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 514 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  27.3 
 
 		 530 aa  107  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 502 aa  106  8e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  27.41 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 476 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 497 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 501 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 540 aa  103  1e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 460 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 522 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 582 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 511 aa  101  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 506 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 527 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 633 aa  100  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 503 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  27.29 
 
 		 511 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 579 aa  98.2  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 531 aa  97.8  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  26.64 
 
 		 531 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.64 
 
 		 499 aa  97.1  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 519 aa  96.7  9e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 592 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 608 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 559 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 530 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 493 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 494 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 547 aa  95.9  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 491 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 506 aa  93.6  9e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 579 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 521 aa  92.8  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 508 aa  92  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 481 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 472 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.25 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.59 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 601 aa  92  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 494 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 503 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 521 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 486 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 503 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 521 aa  87.8  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 610 aa  86.7  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  28.65 
 
 		 750 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 539 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  40.36 
 
 		 566 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>