210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4183 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 610 aa  1266    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  73.92 
 
 		 608 aa  954    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  47.83 
 
 		 633 aa  581  1e-164  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  43.62 
 
 		 583 aa  439  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  37.73 
 
 		 667 aa  359  7e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 560 aa  223  8e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 566 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 551 aa  176  9.999999999999999e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 544 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 574 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 594 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 565 aa  102  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 499 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 555 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 561 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 549 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  30.92 
 
 		 506 aa  84  0.000000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 479 aa  84  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 548 aa  80.9  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 509 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.38 
 
 		 537 aa  77.8  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 491 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  29.88 
 
 		 490 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  31.02 
 
 		 486 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 527 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  40.83 
 
 		 514 aa  75.5  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 481 aa  73.6  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  25.18 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 519 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 664 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 483 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 521 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  31.31 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  29.09 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 457 aa  67  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.77 
 
 		 498 aa  67  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  29.15 
 
 		 534 aa  65.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.68 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 531 aa  65.5  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 612 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  31.33 
 
 		 603 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  22.81 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 508 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 494 aa  63.9  0.000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 493 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 602 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  24.47 
 
 		 618 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  27.63 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.61 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 489 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  32.45 
 
 		 488 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  30.13 
 
 		 503 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 495 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 506 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  38.67 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 622 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  34.11 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  31.93 
 
 		 499 aa  60.1  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 494 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  22.31 
 
 		 600 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  30.57 
 
 		 527 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 549 aa  60.1  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  22.83 
 
 		 530 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  21.85 
 
 		 615 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 480 aa  58.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 613 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 521 aa  58.5  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  22.76 
 
 		 494 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 485 aa  57.8  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.35 
 
 		 499 aa  57.8  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 521 aa  57.8  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  25.87 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  28.36 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  33.59 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 511 aa  57.4  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 531 aa  57.4  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 448 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  23.4 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 479 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.69 
 
 		 487 aa  55.8  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 477 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  40.37 
 
 		 540 aa  55.8  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  22.75 
 
 		 582 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  34.92 
 
 		 591 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  33.75 
 
 		 573 aa  55.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>