245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4105 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 551 aa  1136    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  35.52 
 
 		 560 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  35.53 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  34.87 
 
 		 574 aa  253  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  32.41 
 
 		 542 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  33.16 
 
 		 544 aa  210  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1389  RagB/SusD domain protein  31.83 
 
 		 583 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451306  normal  0.627889 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5675  RagB/SusD domain protein  34.15 
 
 		 608 aa  201  3e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.324394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 610 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 594 aa  172  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  29.95 
 
 		 565 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2821  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 633 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.226587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 556 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 537 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  28.75 
 
 		 561 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 509 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.2 
 
 		 555 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  29.57 
 
 		 573 aa  110  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  26.2 
 
 		 530 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4490  hypothetical protein  27.53 
 
 		 667 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  40.94 
 
 		 557 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 476 aa  84.3  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.85 
 
 		 532 aa  84  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  37.23 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 486 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  24.89 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 521 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  35.4 
 
 		 604 aa  77.4  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 547 aa  77.4  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 550 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  24.39 
 
 		 508 aa  75.1  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 521 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  27.45 
 
 		 750 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.58 
 
 		 507 aa  74.3  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 519 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  37.01 
 
 		 527 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.84 
 
 		 490 aa  73.6  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 501 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 514 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  25.58 
 
 		 487 aa  72.4  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  36.92 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 522 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  33.77 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 500 aa  72  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 521 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 531 aa  70.5  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 491 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  26.4 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 479 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  31.69 
 
 		 508 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  23.81 
 
 		 541 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 538 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 557 aa  68.6  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 507 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  32.86 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  24.82 
 
 		 494 aa  67.4  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  32.64 
 
 		 540 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 520 aa  66.6  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 639 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.56 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 481 aa  66.6  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  33.99 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  23.36 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  24.3 
 
 		 564 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.31 
 
 		 470 aa  64.7  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 522 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 478 aa  63.5  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 486 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  39.81 
 
 		 507 aa  63.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.61 
 
 		 494 aa  62.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 612 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 587 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  36.89 
 
 		 471 aa  62.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 477 aa  62.4  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 615 aa  62.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  35.81 
 
 		 624 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 559 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 472 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 528 aa  62  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 494 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  33.88 
 
 		 493 aa  62  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 499 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  33.93 
 
 		 602 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 448 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  24.52 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  25.23 
 
 		 492 aa  60.8  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  33.87 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.11 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>