285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1709 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 573 aa  1187    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  39.79 
 
 		 537 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  39.1 
 
 		 555 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  41.35 
 
 		 561 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  38.23 
 
 		 556 aa  338  9.999999999999999e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  36.1 
 
 		 604 aa  312  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  34.23 
 
 		 549 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  33.16 
 
 		 548 aa  271  2.9999999999999997e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  34.62 
 
 		 533 aa  266  5e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 565 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3881  RagB/SusD domain-containing protein  30.78 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  31.67 
 
 		 557 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 509 aa  178  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 624 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0794  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 652 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00512087  normal  0.040837 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 544 aa  151  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 480 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 519 aa  134  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 566 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 542 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 521 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 560 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 513 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.03 
 
 		 494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 521 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 602 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  28.62 
 
 		 551 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 502 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  32.34 
 
 		 490 aa  111  3e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  26.49 
 
 		 530 aa  110  6e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  26.43 
 
 		 574 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1016  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 594 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00288117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  34.58 
 
 		 506 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.3 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 514 aa  107  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 603 aa  107  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.23 
 
 		 498 aa  105  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.85 
 
 		 497 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 483 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 579 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 495 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 547 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 508 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 503 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  32.26 
 
 		 522 aa  97.1  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.65 
 
 		 477 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 500 aa  95.5  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 664 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 484 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  29.02 
 
 		 534 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  29.84 
 
 		 494 aa  94  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 618 aa  94  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 494 aa  93.6  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.04 
 
 		 527 aa  93.6  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 486 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 470 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.3 
 
 		 507 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  24.5 
 
 		 582 aa  92.8  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.64 
 
 		 507 aa  91.7  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 540 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 539 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 613 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 479 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 601 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 612 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 527 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 506 aa  89.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 541 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 477 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 493 aa  88.6  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 480 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 548 aa  87.8  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 523 aa  87.4  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 506 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  24.96 
 
 		 750 aa  87  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 501 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 543 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 479 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 491 aa  86.3  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 498 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 559 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  34.9 
 
 		 529 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 491 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 493 aa  83.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  31 
 
 		 540 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 481 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 531 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  29.01 
 
 		 499 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 497 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 491 aa  80.1  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>