More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1282 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 613 aa  1268    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  46.89 
 
 		 603 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  46.82 
 
 		 612 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  42.97 
 
 		 618 aa  435  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  39.91 
 
 		 664 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  46.03 
 
 		 540 aa  374  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  39.78 
 
 		 626 aa  369  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  42.33 
 
 		 527 aa  330  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  41.04 
 
 		 519 aa  292  1e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 622 aa  228  3e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 549 aa  177  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 499 aa  159  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 601 aa  144  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.69 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 491 aa  140  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.19 
 
 		 490 aa  138  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 479 aa  138  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 483 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 495 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 529 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.77 
 
 		 478 aa  134  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.66 
 
 		 494 aa  134  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 506 aa  133  9e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 480 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 477 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 522 aa  131  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 497 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 486 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 481 aa  123  9e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 514 aa  122  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.1 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.2 
 
 		 498 aa  118  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 591 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 501 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 473 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.72 
 
 		 499 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 494 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.27 
 
 		 494 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 483 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.07 
 
 		 522 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 470 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 481 aa  111  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 477 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 519 aa  110  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 502 aa  109  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 541 aa  109  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 497 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 503 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 448 aa  107  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 499 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 489 aa  107  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 486 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 447 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 531 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 506 aa  104  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 556 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  26.91 
 
 		 486 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.33 
 
 		 458 aa  102  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 527 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.45 
 
 		 457 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 460 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 513 aa  100  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.97 
 
 		 487 aa  99.8  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.32 
 
 		 500 aa  99.4  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.62 
 
 		 476 aa  99.4  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 521 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 574 aa  98.2  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 504 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 547 aa  97.8  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 521 aa  97.4  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.73 
 
 		 532 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 479 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 549 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 492 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 496 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 523 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 451 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  30.45 
 
 		 446 aa  94.4  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25 
 
 		 507 aa  93.6  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 510 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 520 aa  91.7  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 452 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 522 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 511 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 573 aa  89  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 512 aa  89  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 548 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 456 aa  87.8  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>