More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3634 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  64.51 
 
 		 512 aa  689    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  64.23 
 
 		 511 aa  667    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 510 aa  1058    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  37.14 
 
 		 483 aa  242  1e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  35.06 
 
 		 481 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  34.64 
 
 		 502 aa  218  2e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  33.27 
 
 		 479 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  32.75 
 
 		 460 aa  213  4.9999999999999996e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  33.59 
 
 		 477 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 501 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 476 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 483 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.35 
 
 		 498 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 470 aa  183  6e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 514 aa  183  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 485 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  30.3 
 
 		 476 aa  175  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 497 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.03 
 
 		 491 aa  172  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 478 aa  169  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 486 aa  163  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  30.66 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 500 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 477 aa  156  7e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 499 aa  156  7e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.73 
 
 		 494 aa  156  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 514 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 503 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 506 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.51 
 
 		 490 aa  149  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 523 aa  147  6e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 499 aa  146  8.000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 511 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 503 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 527 aa  142  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 511 aa  139  1e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 498 aa  138  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  30.17 
 
 		 495 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 520 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 486 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.67 
 
 		 541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.94 
 
 		 511 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 507 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 494 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 534 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 484 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 508 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  26.84 
 
 		 498 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 456 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 472 aa  127  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 603 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 503 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 506 aa  126  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.02 
 
 		 492 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 508 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 488 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 493 aa  124  5e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 521 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  28.5 
 
 		 466 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.95 
 
 		 531 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 527 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.7 
 
 		 507 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 511 aa  121  3e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 451 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 601 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 490 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.77 
 
 		 549 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.5 
 
 		 487 aa  116  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 480 aa  115  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 592 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  25.32 
 
 		 612 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.47 
 
 		 506 aa  114  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 488 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.13 
 
 		 499 aa  113  7.000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  24.49 
 
 		 568 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 469 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 448 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 476 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 479 aa  110  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.85 
 
 		 502 aa  109  9.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.94 
 
 		 521 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 664 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 572 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 531 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.26 
 
 		 549 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 531 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 478 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 624 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  26.31 
 
 		 548 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>