More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2080 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 457 aa  937    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  65.65 
 
 		 458 aa  605  9.999999999999999e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  53.38 
 
 		 447 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  49.67 
 
 		 448 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  46.52 
 
 		 446 aa  377  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  46.95 
 
 		 447 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  41.42 
 
 		 447 aa  291  1e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  34.19 
 
 		 456 aa  186  6e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 499 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 488 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 457 aa  170  5e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.53 
 
 		 483 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 479 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 479 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 478 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.85 
 
 		 476 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 477 aa  166  8e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 510 aa  161  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 472 aa  161  3e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.12 
 
 		 497 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.81 
 
 		 481 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.14 
 
 		 492 aa  156  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  29.31 
 
 		 487 aa  154  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  30.11 
 
 		 461 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 469 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  30.32 
 
 		 493 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  30.51 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  31.95 
 
 		 484 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  30.55 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 466 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 491 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 477 aa  146  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 478 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 480 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 508 aa  145  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 478 aa  143  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 451 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  30.91 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 472 aa  142  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  29.35 
 
 		 480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  29.05 
 
 		 471 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 514 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 476 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.39 
 
 		 494 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 460 aa  133  6.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  28.23 
 
 		 503 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  31.16 
 
 		 497 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  31.66 
 
 		 506 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 522 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 490 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.59 
 
 		 490 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  27.8 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  33.51 
 
 		 466 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 481 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.69 
 
 		 485 aa  126  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 506 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29.68 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.07 
 
 		 473 aa  124  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 462 aa  123  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 448 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 494 aa  122  9.999999999999999e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 500 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  28.25 
 
 		 426 aa  119  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 483 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  28.94 
 
 		 471 aa  118  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 470 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 464 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 486 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 491 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 496 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 492 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.05 
 
 		 512 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.54 
 
 		 527 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  26.36 
 
 		 515 aa  110  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 513 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 498 aa  109  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  28.99 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 494 aa  109  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.94 
 
 		 532 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 504 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 486 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.48 
 
 		 476 aa  106  8e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 519 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 491 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  26.24 
 
 		 501 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 541 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.62 
 
 		 499 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 495 aa  103  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.56 
 
 		 511 aa  103  7e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>