More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3213 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 510 aa  1050    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  41.02 
 
 		 493 aa  364  2e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  41.15 
 
 		 478 aa  362  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  43.49 
 
 		 484 aa  354  2e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  39.18 
 
 		 494 aa  337  3.9999999999999995e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  41.6 
 
 		 472 aa  329  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  42.27 
 
 		 464 aa  325  1e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  41.24 
 
 		 480 aa  323  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  38.76 
 
 		 472 aa  322  9.999999999999999e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  40.41 
 
 		 456 aa  318  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  38.13 
 
 		 479 aa  312  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  38.68 
 
 		 461 aa  310  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  41.72 
 
 		 480 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  39.75 
 
 		 453 aa  298  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  37.07 
 
 		 469 aa  291  2e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  37.27 
 
 		 471 aa  279  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  37.08 
 
 		 467 aa  278  1e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  37.09 
 
 		 452 aa  273  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  37.11 
 
 		 471 aa  270  5e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  36.53 
 
 		 466 aa  262  1e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  35.29 
 
 		 462 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  36.03 
 
 		 476 aa  244  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  31.79 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  35.23 
 
 		 466 aa  225  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  30 
 
 		 458 aa  167  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  31.24 
 
 		 447 aa  167  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 448 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 457 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.59 
 
 		 477 aa  154  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 478 aa  153  7e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 479 aa  147  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 481 aa  141  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 483 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 481 aa  139  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 494 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 456 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 506 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 502 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  32.83 
 
 		 486 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  29.15 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.51 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 476 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  29.65 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 479 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 477 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.25 
 
 		 497 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 494 aa  116  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 499 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.39 
 
 		 488 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 504 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.08 
 
 		 499 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 492 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  27.64 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.25 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.78 
 
 		 506 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 498 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 503 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.88 
 
 		 487 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 497 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 527 aa  104  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 490 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 491 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 469 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 460 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 521 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 527 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 486 aa  99  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 490 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 485 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 475 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 537 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 511 aa  97.4  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 622 aa  97.4  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 523 aa  96.7  9e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.41 
 
 		 498 aa  96.7  9e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 483 aa  95.9  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.59 
 
 		 490 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 503 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 501 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 549 aa  96.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 503 aa  95.9  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  44.96 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 508 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 603 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  26.14 
 
 		 527 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 514 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 495 aa  94.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 512 aa  93.6  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 486 aa  93.2  9e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  26.16 
 
 		 440 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 491 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>