More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3557 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  100 
 
 		 467 aa  958    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  51.27 
 
 		 471 aa  483  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  50.11 
 
 		 471 aa  466  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  38.46 
 
 		 478 aa  326  6e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  40.57 
 
 		 461 aa  323  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  38.07 
 
 		 456 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  38.11 
 
 		 472 aa  296  5e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  37.2 
 
 		 464 aa  290  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  37.47 
 
 		 469 aa  289  7e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  37.92 
 
 		 510 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  40.67 
 
 		 484 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  37.66 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  37.63 
 
 		 479 aa  279  6e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  37.18 
 
 		 472 aa  275  9e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  35.76 
 
 		 493 aa  272  7e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  35.76 
 
 		 494 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  38.51 
 
 		 480 aa  259  7e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  37.04 
 
 		 480 aa  257  4e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  34.75 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  35.03 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  34.04 
 
 		 466 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  32.96 
 
 		 464 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 476 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  33.19 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 		 448 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 447 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  30.96 
 
 		 458 aa  146  7.0000000000000006e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 457 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 457 aa  137  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.22 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 477 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  28.29 
 
 		 446 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  31.39 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 478 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 479 aa  127  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.29 
 
 		 476 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 477 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 499 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.1 
 
 		 447 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 502 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.47 
 
 		 481 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.06 
 
 		 483 aa  118  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 486 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.26 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 494 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.21 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 480 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  28.45 
 
 		 485 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 488 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  24.89 
 
 		 487 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  28.82 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 506 aa  107  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 473 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.97 
 
 		 499 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.6 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  31.18 
 
 		 426 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.38 
 
 		 490 aa  102  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  29.6 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 479 aa  101  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 507 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 462 aa  99.4  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 508 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 503 aa  99.4  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 506 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  30.29 
 
 		 459 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 511 aa  97.8  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 510 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 506 aa  97.1  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 491 aa  97.1  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.79 
 
 		 498 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 488 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 500 aa  96.3  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 491 aa  95.1  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.4 
 
 		 476 aa  95.5  2e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.8 
 
 		 498 aa  94.7  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.25 
 
 		 486 aa  94.7  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 478 aa  95.1  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 511 aa  94  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 492 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 522 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.88 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 494 aa  91.7  3e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  25.39 
 
 		 531 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  27.7 
 
 		 506 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  26.61 
 
 		 504 aa  90.1  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 470 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  22.18 
 
 		 527 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 509 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 491 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 491 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.24 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1098  hypothetical protein  23.98 
 
 		 488 aa  85.1  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000776149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 493 aa  84.3  0.000000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 514 aa  84  0.000000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>