More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05675 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  928    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  39.87 
 
 		 478 aa  317  3e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  34.43 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  34.39 
 
 		 451 aa  187  4e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  32.85 
 
 		 456 aa  179  9e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 447 aa  162  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30.79 
 
 		 448 aa  160  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  32.63 
 
 		 447 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  31.09 
 
 		 483 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 469 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 476 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 500 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.63 
 
 		 483 aa  140  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  30.36 
 
 		 458 aa  139  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 481 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  32.92 
 
 		 477 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 447 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 478 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 510 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 486 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 491 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  27.65 
 
 		 446 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 497 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  30.82 
 
 		 466 aa  129  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 456 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 488 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  29.36 
 
 		 499 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 486 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  30.13 
 
 		 499 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 462 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 457 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  29.98 
 
 		 500 aa  123  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.18 
 
 		 479 aa  123  8e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 488 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.37 
 
 		 476 aa  123  9e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.56 
 
 		 506 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  27.22 
 
 		 532 aa  121  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 522 aa  121  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  29.08 
 
 		 514 aa  120  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.14 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 507 aa  116  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 481 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 493 aa  116  7.999999999999999e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 482 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  28.92 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 480 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.83 
 
 		 494 aa  114  3e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.22 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  27.55 
 
 		 534 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  27.77 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.93 
 
 		 471 aa  110  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 494 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 486 aa  109  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 504 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 479 aa  108  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 491 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.32 
 
 		 490 aa  107  5e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  26.83 
 
 		 507 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  28.24 
 
 		 492 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  27.93 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 494 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.08 
 
 		 487 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 460 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.89 
 
 		 511 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 501 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 513 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 499 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  29.31 
 
 		 480 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 511 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  26.86 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 506 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.07 
 
 		 484 aa  100  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.5 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 480 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  26.32 
 
 		 515 aa  98.6  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  26.38 
 
 		 467 aa  99  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 548 aa  98.6  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 493 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 486 aa  97.8  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 549 aa  97.8  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  27.14 
 
 		 507 aa  97.1  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 497 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 495 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4549  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 476 aa  97.4  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0213349  normal  0.0641014 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 540 aa  97.1  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 464 aa  96.7  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  26.7 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 453 aa  95.9  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>