More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2232 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 486 aa  996    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  40.33 
 
 		 476 aa  326  5e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  38.6 
 
 		 490 aa  316  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  38.45 
 
 		 479 aa  302  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  38.75 
 
 		 494 aa  290  3e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  38.29 
 
 		 477 aa  272  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  35.6 
 
 		 477 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  36.03 
 
 		 478 aa  265  2e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  36.51 
 
 		 483 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  37.4 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  36.36 
 
 		 481 aa  258  2e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  34.26 
 
 		 522 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  35.24 
 
 		 473 aa  244  3e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  34.24 
 
 		 499 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  32.95 
 
 		 491 aa  230  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  35.35 
 
 		 502 aa  229  6e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  35.14 
 
 		 470 aa  229  8e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 503 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  34.26 
 
 		 498 aa  222  9.999999999999999e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  33.85 
 
 		 501 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  32.28 
 
 		 499 aa  218  2.9999999999999998e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  34.53 
 
 		 460 aa  217  4e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  31.12 
 
 		 549 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.01 
 
 		 494 aa  213  3.9999999999999995e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  34.22 
 
 		 506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  34.12 
 
 		 479 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  33.67 
 
 		 491 aa  213  5.999999999999999e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  32.19 
 
 		 506 aa  210  5e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  34.56 
 
 		 494 aa  209  6e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  34.05 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  32.05 
 
 		 521 aa  206  1e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  34.27 
 
 		 527 aa  206  1e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.31 
 
 		 480 aa  203  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  31.91 
 
 		 481 aa  204  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  32.52 
 
 		 519 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  33.21 
 
 		 521 aa  202  9.999999999999999e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 541 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  33.13 
 
 		 503 aa  200  6e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 500 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 519 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 601 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 483 aa  194  4e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  32.81 
 
 		 485 aa  193  5e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  32.9 
 
 		 522 aa  193  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 487 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  31.72 
 
 		 503 aa  192  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  32.12 
 
 		 499 aa  189  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  31.01 
 
 		 506 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  30.6 
 
 		 494 aa  186  7e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 527 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  30.23 
 
 		 495 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  30.45 
 
 		 508 aa  176  8e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  32.84 
 
 		 514 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 540 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  31.39 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 514 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  32.05 
 
 		 505 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  30.24 
 
 		 534 aa  171  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  30.8 
 
 		 510 aa  170  5e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  31.96 
 
 		 511 aa  169  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  30.75 
 
 		 499 aa  169  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  29.47 
 
 		 491 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 448 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  29.96 
 
 		 476 aa  164  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  30.75 
 
 		 494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 497 aa  163  8.000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.01 
 
 		 487 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 531 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  30.95 
 
 		 486 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  29.58 
 
 		 513 aa  160  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 496 aa  158  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 499 aa  158  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 493 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 488 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 511 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.25 
 
 		 511 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 507 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 479 aa  153  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  30.26 
 
 		 511 aa  152  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 490 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  28.93 
 
 		 664 aa  150  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.19 
 
 		 492 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 488 aa  150  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 461 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  31.66 
 
 		 612 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 512 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 511 aa  146  7.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.49 
 
 		 498 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  30.99 
 
 		 511 aa  146  1e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 506 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  30.02 
 
 		 472 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 521 aa  144  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 489 aa  144  5e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 540 aa  143  8e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  27.25 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>