More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4041 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 477 aa  981    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  39.63 
 
 		 476 aa  317  2e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  41.55 
 
 		 483 aa  317  3e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  39.07 
 
 		 494 aa  309  9e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  39.53 
 
 		 494 aa  289  9e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  38.7 
 
 		 479 aa  280  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  39.09 
 
 		 499 aa  272  1e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  37.23 
 
 		 477 aa  268  2e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  38.29 
 
 		 486 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  37.91 
 
 		 494 aa  256  9e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  36.94 
 
 		 490 aa  253  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  37.76 
 
 		 506 aa  251  2e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 507 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  37.25 
 
 		 478 aa  250  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  36.53 
 
 		 460 aa  244  3e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  34.49 
 
 		 481 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  34.71 
 
 		 491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  36.96 
 
 		 508 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  33.08 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  34.1 
 
 		 541 aa  222  9.999999999999999e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  37.1 
 
 		 499 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  35.46 
 
 		 486 aa  218  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 511 aa  215  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  34.19 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  34.83 
 
 		 493 aa  213  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  34.62 
 
 		 473 aa  213  9e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  33.47 
 
 		 470 aa  212  1e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  34.62 
 
 		 487 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  34.39 
 
 		 498 aa  210  4e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  35.32 
 
 		 486 aa  209  7e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  34.66 
 
 		 511 aa  209  1e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  34.91 
 
 		 513 aa  207  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  33.7 
 
 		 531 aa  208  2e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 495 aa  203  6e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  32.3 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  34.22 
 
 		 497 aa  202  9.999999999999999e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  33.01 
 
 		 500 aa  201  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 529 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  35.44 
 
 		 522 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  34.04 
 
 		 501 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  31.99 
 
 		 488 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  33.59 
 
 		 498 aa  194  3e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  33.21 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  35.06 
 
 		 503 aa  189  8e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 549 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  31.32 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 531 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  31.76 
 
 		 485 aa  186  6e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  34.81 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  32.38 
 
 		 519 aa  182  1e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  33.53 
 
 		 489 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  32.02 
 
 		 480 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  31.59 
 
 		 504 aa  181  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 488 aa  180  4.999999999999999e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  31.66 
 
 		 448 aa  180  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 548 aa  179  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  30.65 
 
 		 520 aa  178  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  30.93 
 
 		 531 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 521 aa  177  4e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  29.68 
 
 		 579 aa  176  6e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  33.52 
 
 		 522 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  29.62 
 
 		 481 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  30.95 
 
 		 511 aa  173  5e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  34.37 
 
 		 521 aa  172  7.999999999999999e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 521 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  30.72 
 
 		 532 aa  169  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  32.33 
 
 		 514 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 549 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  30.04 
 
 		 503 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 506 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 582 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  30.19 
 
 		 527 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 511 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  28.72 
 
 		 576 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  30.92 
 
 		 503 aa  166  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 457 aa  166  9e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 494 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  29.98 
 
 		 511 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 447 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.16 
 
 		 512 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.63 
 
 		 458 aa  163  6e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  31.45 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  29.54 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 592 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 534 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  30.23 
 
 		 519 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  29.78 
 
 		 511 aa  160  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  31.63 
 
 		 506 aa  160  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  29.44 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  32.29 
 
 		 447 aa  160  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  31.69 
 
 		 532 aa  160  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 598 aa  159  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 497 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 588 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 508 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 510 aa  156  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  33.25 
 
 		 452 aa  156  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>