More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2846 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 487 aa  1008    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 476 aa  198  2.0000000000000003e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  32.89 
 
 		 499 aa  194  3e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 486 aa  190  5e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  30.34 
 
 		 499 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.57 
 
 		 479 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  32.61 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 477 aa  166  9e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 481 aa  166  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.53 
 
 		 494 aa  160  6e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.57 
 
 		 490 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 460 aa  157  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  30.59 
 
 		 539 aa  150  5e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  29.64 
 
 		 494 aa  149  9e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 519 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  32.69 
 
 		 477 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 488 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 549 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  31.46 
 
 		 486 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.71 
 
 		 497 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 527 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 522 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.72 
 
 		 506 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.29 
 
 		 507 aa  137  4e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 497 aa  137  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 494 aa  135  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 478 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  28.99 
 
 		 548 aa  133  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 501 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  28.06 
 
 		 523 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 478 aa  131  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  24.61 
 
 		 481 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 507 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 531 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 508 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.56 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  30.83 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  30.99 
 
 		 519 aa  129  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  28.55 
 
 		 540 aa  127  5e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.46 
 
 		 511 aa  127  5e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.28 
 
 		 506 aa  126  7e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.72 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 519 aa  125  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  26.7 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  28.04 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 537 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.94 
 
 		 499 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 469 aa  124  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 491 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 549 aa  124  5e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 557 aa  123  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  28.68 
 
 		 530 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  29.21 
 
 		 479 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 491 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  27.59 
 
 		 530 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 479 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 498 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 531 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 538 aa  116  8.999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  30.03 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.12 
 
 		 502 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.89 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25.8 
 
 		 564 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  27.62 
 
 		 540 aa  114  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 534 aa  113  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 506 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  27.37 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 464 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 457 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 521 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 514 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 499 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 496 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 521 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 570 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 527 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 488 aa  107  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 599 aa  107  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  26.08 
 
 		 476 aa  107  7e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  27.62 
 
 		 534 aa  106  8e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.87 
 
 		 571 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 503 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.43 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.87 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 527 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 493 aa  104  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>