273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0639 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 537 aa  1121    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  46.82 
 
 		 527 aa  457  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  45.82 
 
 		 538 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  31.48 
 
 		 493 aa  248  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  33.33 
 
 		 537 aa  243  9e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  30.62 
 
 		 504 aa  237  4e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 542 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  29.65 
 
 		 539 aa  206  6e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 539 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.79 
 
 		 502 aa  199  9e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 575 aa  185  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  28.37 
 
 		 538 aa  183  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  27.64 
 
 		 577 aa  176  8e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 543 aa  176  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  26.85 
 
 		 529 aa  159  9e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 515 aa  157  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 513 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  25.92 
 
 		 540 aa  137  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  27.46 
 
 		 519 aa  135  1.9999999999999998e-30  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 562 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  25.3 
 
 		 530 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  27.63 
 
 		 534 aa  130  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  27.53 
 
 		 487 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  24.47 
 
 		 588 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.05 
 
 		 476 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.62 
 
 		 477 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.82 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 477 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  26.12 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4417  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 578 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000899968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 555 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 486 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 483 aa  110  7.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 541 aa  110  8.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 499 aa  100  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 493 aa  99.4  1e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 502 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 519 aa  99  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 506 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 497 aa  99.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 499 aa  98.6  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  27.18 
 
 		 565 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.73 
 
 		 507 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 503 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  23.53 
 
 		 460 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 523 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 480 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 494 aa  93.6  7e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 499 aa  93.6  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  22.18 
 
 		 527 aa  93.2  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.81 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 520 aa  92.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 498 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  24.82 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.04 
 
 		 498 aa  91.3  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 601 aa  90.9  5e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 499 aa  90.9  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 479 aa  90.9  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.2 
 
 		 594 aa  90.1  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 549 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  24.83 
 
 		 514 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 484 aa  88.6  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 507 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 491 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  22.72 
 
 		 603 aa  87.4  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  22.06 
 
 		 492 aa  87.4  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.08 
 
 		 487 aa  86.7  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  23.41 
 
 		 547 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.68 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 534 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.29 
 
 		 496 aa  85.9  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  22.16 
 
 		 490 aa  85.1  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 472 aa  84.3  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 592 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 495 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 548 aa  84  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  24.72 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.83 
 
 		 514 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 486 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 570 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 501 aa  81.3  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  23.91 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 464 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  23.62 
 
 		 510 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  22.7 
 
 		 549 aa  80.9  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  23.72 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  22.53 
 
 		 664 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 537 aa  80.1  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 584 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>