276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1459 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 592 aa  1217    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  56.67 
 
 		 588 aa  688    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  64.84 
 
 		 601 aa  787    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  59.8 
 
 		 598 aa  731    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  50 
 
 		 582 aa  561  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  49.49 
 
 		 582 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4947  RagB/SusD domain protein  49.92 
 
 		 579 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.993006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  47.13 
 
 		 576 aa  499  1e-140  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  47.19 
 
 		 592 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  44.07 
 
 		 594 aa  476  1e-133  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  41.57 
 
 		 592 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  45.2 
 
 		 579 aa  426  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  36.77 
 
 		 570 aa  306  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  34.31 
 
 		 556 aa  213  7.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  30.08 
 
 		 483 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 541 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 499 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 508 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.99 
 
 		 477 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  27.68 
 
 		 499 aa  144  6e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  28.98 
 
 		 486 aa  141  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.69 
 
 		 498 aa  137  5e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  27.56 
 
 		 507 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 493 aa  136  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 506 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 555 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  27.29 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 579 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 511 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 507 aa  122  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 494 aa  120  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 501 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.84 
 
 		 490 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  30.16 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 484 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 511 aa  113  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 549 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  26.2 
 
 		 533 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 548 aa  110  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  25.04 
 
 		 494 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 478 aa  107  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  26.88 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 483 aa  107  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.09 
 
 		 500 aa  107  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  27.38 
 
 		 548 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 520 aa  104  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 508 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.06 
 
 		 486 aa  103  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 561 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 556 aa  101  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 577 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28 
 
 		 514 aa  101  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.21 
 
 		 476 aa  98.6  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 503 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 491 aa  95.9  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  30.77 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 523 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 514 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 522 aa  94.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 531 aa  94  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 497 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 531 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 549 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 531 aa  92.4  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 529 aa  92  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 534 aa  92  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 485 aa  91.3  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  32.42 
 
 		 480 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 503 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 521 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 489 aa  89.4  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.51 
 
 		 511 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  24.36 
 
 		 532 aa  88.2  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 481 aa  88.2  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  22.85 
 
 		 507 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  29.97 
 
 		 460 aa  87.4  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  24.34 
 
 		 540 aa  87.4  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 513 aa  87  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.27 
 
 		 487 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 639 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 477 aa  84.3  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 492 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 568 aa  82.4  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.03 
 
 		 487 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 568 aa  81.3  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2078  RagB/SusD domain-containing protein  25.31 
 
 		 530 aa  81.3  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 522 aa  80.9  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  24.35 
 
 		 509 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 473 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 519 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 528 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  30.93 
 
 		 511 aa  78.2  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 488 aa  77.8  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  28.42 
 
 		 495 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 540 aa  77.4  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  26.57 
 
 		 461 aa  77.8  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.84 
 
 		 476 aa  76.6  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>