272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1384 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 505 aa  1050    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  31.24 
 
 		 481 aa  207  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  29.78 
 
 		 479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 540 aa  126  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.79 
 
 		 519 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 478 aa  120  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 480 aa  120  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 477 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 494 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  29.27 
 
 		 498 aa  118  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  25.14 
 
 		 494 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  25.95 
 
 		 490 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 476 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 486 aa  114  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 494 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  25.48 
 
 		 499 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 460 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.67 
 
 		 549 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  26.76 
 
 		 485 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 519 aa  106  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 484 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 491 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 503 aa  103  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 507 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 522 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 549 aa  100  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 481 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 523 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.69 
 
 		 507 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.53 
 
 		 486 aa  98.6  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  25.37 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  24.17 
 
 		 498 aa  97.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 529 aa  97.4  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 508 aa  95.5  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 473 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 503 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 506 aa  95.1  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 496 aa  94.4  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 502 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 591 aa  92.4  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 511 aa  90.9  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 510 aa  90.9  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.52 
 
 		 506 aa  90.5  6e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  23.36 
 
 		 601 aa  89.7  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 472 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 483 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 603 aa  89.7  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 495 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  25.72 
 
 		 497 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.65 
 
 		 541 aa  88.2  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 506 aa  87.8  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.38 
 
 		 511 aa  87.4  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 520 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  27.26 
 
 		 520 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 512 aa  86.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  26.95 
 
 		 489 aa  86.7  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.85 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 531 aa  85.5  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 622 aa  84.7  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  25.25 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  23.14 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  26.85 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 461 aa  84.7  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 613 aa  84.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.8 
 
 		 594 aa  83.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 511 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 592 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 499 aa  82.4  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  24.63 
 
 		 508 aa  82  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  25.56 
 
 		 528 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 573 aa  80.5  0.00000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  23.71 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  22.56 
 
 		 487 aa  80.1  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  22.99 
 
 		 664 aa  80.1  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 522 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 493 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  23.7 
 
 		 506 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 524 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 500 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  26.48 
 
 		 532 aa  77.4  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  22.79 
 
 		 557 aa  75.9  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 480 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2261  RagB/SusD domain protein  24.14 
 
 		 560 aa  76.6  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  23.52 
 
 		 537 aa  76.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 556 aa  75.5  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  24.76 
 
 		 492 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>