220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1154 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1154  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 592 aa  1215    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0747551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0184  RagB/SusD domain-containing protein  52.07 
 
 		 604 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0583886  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0771  RagB/SusD domain protein  34.05 
 
 		 591 aa  278  1e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 549 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 540 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 622 aa  126  1e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 519 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 527 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 664 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 512 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.48 
 
 		 494 aa  114  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  26.99 
 
 		 572 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 618 aa  107  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.66 
 
 		 503 aa  103  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 520 aa  103  8e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 476 aa  103  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 477 aa  102  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 499 aa  102  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 486 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 483 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 499 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  24.64 
 
 		 521 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.67 
 
 		 511 aa  96.3  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 612 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 511 aa  96.7  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.95 
 
 		 498 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 523 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  26.19 
 
 		 527 aa  91.7  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 511 aa  90.9  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 534 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.51 
 
 		 479 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  24.7 
 
 		 510 aa  90.5  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  26.3 
 
 		 497 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.72 
 
 		 500 aa  88.6  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28.17 
 
 		 487 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 479 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.91 
 
 		 494 aa  85.1  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 521 aa  84.3  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 498 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1779  RagB/SusD domain protein  24.4 
 
 		 485 aa  83.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  24.78 
 
 		 626 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  23.1 
 
 		 579 aa  82.8  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 460 aa  82.8  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1384  RagB/SusD domain protein  25.7 
 
 		 505 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116245  normal  0.23383 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.6 
 
 		 490 aa  81.6  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.69 
 
 		 506 aa  81.3  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 514 aa  80.5  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  23.36 
 
 		 502 aa  80.1  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2644  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 490 aa  80.1  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.941538 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  26.13 
 
 		 458 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  29.63 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.47 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 527 aa  78.2  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 529 aa  78.2  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 493 aa  77.8  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  24.56 
 
 		 507 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 494 aa  74.3  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  25.46 
 
 		 557 aa  74.3  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  23.7 
 
 		 531 aa  73.9  0.000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.24 
 
 		 511 aa  73.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 486 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  22.91 
 
 		 520 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  24.94 
 
 		 522 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.26 
 
 		 499 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.65 
 
 		 488 aa  70.9  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  28.61 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 528 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  27.98 
 
 		 499 aa  70.5  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  25.38 
 
 		 508 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 503 aa  70.5  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  23.84 
 
 		 613 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 472 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  24.04 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  23.96 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 483 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 491 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.36 
 
 		 489 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  25.81 
 
 		 532 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  25.17 
 
 		 537 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  24.57 
 
 		 447 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.97 
 
 		 461 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 541 aa  67.4  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 448 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  31.66 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  25.53 
 
 		 541 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  23.32 
 
 		 476 aa  66.2  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.93 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2626  RagB/SusD domain protein  22.49 
 
 		 507 aa  64.7  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0592076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  28.29 
 
 		 494 aa  64.3  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  29.3 
 
 		 462 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>