279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4558 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  68.28 
 
 		 561 aa  771    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 555 aa  1148    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  37.85 
 
 		 568 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  36.38 
 
 		 568 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  34.21 
 
 		 615 aa  280  5e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  34.77 
 
 		 564 aa  270  5e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  34.63 
 
 		 584 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  37.15 
 
 		 559 aa  267  4e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  35.06 
 
 		 571 aa  266  5.999999999999999e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  32.35 
 
 		 600 aa  266  7e-70  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  33.62 
 
 		 557 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  35.99 
 
 		 594 aa  252  1e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  35.52 
 
 		 583 aa  245  9.999999999999999e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  36.63 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  34.55 
 
 		 531 aa  241  2.9999999999999997e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  32.82 
 
 		 615 aa  233  7.000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  30.12 
 
 		 626 aa  231  2e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  30.62 
 
 		 593 aa  231  3e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  35.11 
 
 		 531 aa  230  6e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 623 aa  225  1e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  36.9 
 
 		 527 aa  224  3e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  38.46 
 
 		 566 aa  220  7e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  31.22 
 
 		 584 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 505 aa  211  3e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 599 aa  211  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 529 aa  209  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 568 aa  205  2e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  34.58 
 
 		 582 aa  182  2e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  32.82 
 
 		 549 aa  182  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 511 aa  177  6e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  34.35 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  33.67 
 
 		 587 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  29.74 
 
 		 673 aa  171  3e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  31.97 
 
 		 540 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 629 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 587 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 629 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 638 aa  156  7e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 636 aa  152  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 477 aa  150  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  32.19 
 
 		 625 aa  150  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.48 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 528 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.43 
 
 		 489 aa  146  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  29.67 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  28.28 
 
 		 666 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 642 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 627 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  29.9 
 
 		 579 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  27.65 
 
 		 639 aa  133  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 499 aa  133  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 508 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.41 
 
 		 541 aa  130  6e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  27.1 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 484 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  27.49 
 
 		 631 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  27.51 
 
 		 617 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  25.08 
 
 		 630 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 476 aa  126  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 633 aa  124  7e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 507 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 582 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25.87 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.14 
 
 		 494 aa  119  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 579 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 498 aa  117  5e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 477 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 483 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  27.15 
 
 		 478 aa  117  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  25.41 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 486 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  24.1 
 
 		 494 aa  115  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 550 aa  114  5e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  24.6 
 
 		 607 aa  114  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  29.46 
 
 		 511 aa  114  6e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  22.83 
 
 		 476 aa  113  9e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.42 
 
 		 481 aa  110  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.33 
 
 		 499 aa  110  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 480 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  25.95 
 
 		 506 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.41 
 
 		 514 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 488 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 502 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 638 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  26.04 
 
 		 611 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.49 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 540 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 487 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  25.47 
 
 		 540 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 495 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  27.01 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  27.87 
 
 		 614 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  26.8 
 
 		 497 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  31.17 
 
 		 620 aa  102  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  26.23 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.58 
 
 		 494 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>