285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1487 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4558  RagB/SusD domain protein  68.28 
 
 		 555 aa  763    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.001407  normal  0.0159313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1487  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 561 aa  1154    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.424946 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  38.18 
 
 		 568 aa  313  4.999999999999999e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  35.37 
 
 		 615 aa  297  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  34.25 
 
 		 564 aa  290  4e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  35.91 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  32.97 
 
 		 600 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  35.43 
 
 		 584 aa  280  4e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2721  RagB/SusD domain protein  39.24 
 
 		 559 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  33.5 
 
 		 568 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  33.81 
 
 		 623 aa  260  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  32.87 
 
 		 626 aa  258  2e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  35.43 
 
 		 583 aa  258  2e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  33.81 
 
 		 615 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  33.66 
 
 		 594 aa  250  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1019  RagB/SusD domain protein  35.67 
 
 		 566 aa  249  1e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  36.42 
 
 		 565 aa  240  5.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  34.57 
 
 		 557 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  34.88 
 
 		 527 aa  233  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  32.74 
 
 		 531 aa  229  1e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  33.04 
 
 		 505 aa  224  2e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 593 aa  224  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  33.01 
 
 		 584 aa  224  4e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 531 aa  219  1e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 599 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  31.33 
 
 		 620 aa  212  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  32.08 
 
 		 568 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 529 aa  197  6e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 511 aa  192  1e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  33.91 
 
 		 587 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  30.09 
 
 		 582 aa  180  7e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4737  RagB/SusD domain protein  37.3 
 
 		 625 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 549 aa  174  5e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0565  RagB/SusD domain protein  30.4 
 
 		 673 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.642447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3876  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 587 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 636 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1849  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 557 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 477 aa  155  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  30.89 
 
 		 489 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  26.4 
 
 		 629 aa  151  3e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  30.39 
 
 		 666 aa  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  30.72 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  26.34 
 
 		 629 aa  144  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4100  RagB/SusD domain protein  26.9 
 
 		 638 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 595 aa  139  2e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  27.85 
 
 		 642 aa  136  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  32.23 
 
 		 540 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 630 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 633 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.35 
 
 		 499 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.24 
 
 		 484 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  30.35 
 
 		 528 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 476 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 479 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 631 aa  127  7e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2102  RagB/SusD domain protein  26.13 
 
 		 617 aa  126  8.000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.337622  normal  0.239188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0554  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 582 aa  126  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 494 aa  125  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 499 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 576 aa  125  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 508 aa  124  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.42 
 
 		 476 aa  123  8e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1021  RagB/SusD domain protein  26.16 
 
 		 582 aa  121  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00103937  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 579 aa  120  6e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 627 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.33 
 
 		 507 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.57 
 
 		 494 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  27.46 
 
 		 498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 611 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 481 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  29.32 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 478 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 506 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.36 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 576 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 588 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6797  RagB/SusD domain protein  25.29 
 
 		 638 aa  106  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000012034  hitchhiker  0.000000000461447 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  27.44 
 
 		 576 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  27.84 
 
 		 511 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 495 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 488 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 596 aa  104  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 483 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 601 aa  103  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 550 aa  102  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 607 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  26.57 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 519 aa  102  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  23.97 
 
 		 480 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 512 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  24.68 
 
 		 577 aa  100  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.9 
 
 		 477 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 506 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  25.91 
 
 		 499 aa  99.4  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 486 aa  99.4  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>