179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1140 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_1140  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 650 aa  1345    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2403  RagB/SusD domain protein  30.07 
 
 		 576 aa  163  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2989  RagB/SusD domain protein  29.22 
 
 		 588 aa  163  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.157394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6659  RagB/SusD domain protein  29.81 
 
 		 576 aa  156  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.913597  normal  0.982088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1684  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 611 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390743  normal  0.0953586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2248  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 596 aa  143  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1556  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.31558 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3772  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 606 aa  140  6e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4978  RagB/SusD domain protein  29.11 
 
 		 576 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000462292 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4761  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 540 aa  124  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4815  RagB/SusD domain-containing protein  24.48 
 
 		 577 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202345  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4125  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 602 aa  109  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0154809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 568 aa  95.9  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4696  RagB/SusD domain protein  23.99 
 
 		 639 aa  93.6  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000012975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5836  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 620 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.857238 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2721  RagB/SusD domain protein  25.78 
 
 		 550 aa  90.1  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0628838  normal  0.846389 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  26.48 
 
 		 582 aa  89.4  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4503  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 607 aa  87.8  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.468205  normal  0.602053 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 599 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4138  RagB/SusD domain protein  23.09 
 
 		 612 aa  83.2  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.37111  normal  0.50692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1590  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 540 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.361992 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1420  RagB/SusD domain protein  25.71 
 
 		 594 aa  81.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0201854 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 531 aa  80.5  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4813  RagB/SusD domain protein  22.72 
 
 		 568 aa  79.7  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00404134  unclonable  0.0000000000000282037 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2640  RagB/SusD domain protein  25.34 
 
 		 584 aa  79  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0117999  normal  0.357997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 564 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  29.66 
 
 		 489 aa  75.5  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3644  RagB/SusD domain protein  24.67 
 
 		 615 aa  75.1  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158423  normal  0.455687 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2242  RagB/SusD domain protein  24.11 
 
 		 557 aa  75.1  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0577944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2298  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 629 aa  74.7  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0544973 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3405  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 600 aa  74.3  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 531 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1299  RagB/SusD domain protein  23.8 
 
 		 565 aa  72.8  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 571 aa  71.2  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0711  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 642 aa  70.9  0.00000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0174034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1125  RagB/SusD domain protein  22.72 
 
 		 583 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256792 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1801  RagB/SusD domain protein  23.75 
 
 		 587 aa  70.5  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4636  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00173325  normal  0.0770072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  24.12 
 
 		 579 aa  69.7  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  24.2 
 
 		 603 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2473  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 615 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113364  normal  0.242072 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4286  RagB/SusD domain protein  28.2 
 
 		 630 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  28.88 
 
 		 604 aa  65.5  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2666  RagB/SusD domain protein  22.59 
 
 		 528 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.453951  normal  0.89358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  26.99 
 
 		 557 aa  64.3  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0355  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 633 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0973758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 499 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  31.15 
 
 		 487 aa  63.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  26.67 
 
 		 511 aa  62.4  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  26.81 
 
 		 613 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  23.06 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.25 
 
 		 448 aa  62.4  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 505 aa  62  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4974  RagB/SusD domain protein  26.21 
 
 		 636 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 479 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 547 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  23.23 
 
 		 548 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 631 aa  61.2  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  27.9 
 
 		 498 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6447  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 527 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0301  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 626 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788503  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  24.83 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  30.51 
 
 		 494 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  30.25 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  23.18 
 
 		 559 aa  58.9  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 614 aa  58.5  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  21.25 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3024  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 524 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.865833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 492 aa  57.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  25.59 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 530 aa  57.8  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2104  RagB/SusD domain protein  29.86 
 
 		 581 aa  57.4  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.475472 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 490 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 540 aa  57  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.18 
 
 		 480 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 484 aa  57  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  27.71 
 
 		 491 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 664 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2809  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 627 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0471827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2475  RagB/SusD domain protein  29.33 
 
 		 623 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241068  normal  0.472175 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  25.53 
 
 		 458 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.23 
 
 		 622 aa  55.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 522 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 497 aa  55.1  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0502  RagB/SusD domain protein  25.63 
 
 		 677 aa  55.1  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00011099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 520 aa  54.7  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  28.82 
 
 		 519 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 464 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  31.03 
 
 		 491 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  27.92 
 
 		 515 aa  54.3  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 601 aa  54.3  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.4 
 
 		 527 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  25.45 
 
 		 506 aa  54.3  0.000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 506 aa  53.9  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>