86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_2009 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  100 
 
 		 467 aa  960    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3801  RagB/SusD domain-containing protein  31.02 
 
 		 474 aa  183  7e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  28.69 
 
 		 463 aa  152  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 456 aa  151  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  30.24 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2946  hypothetical protein  28.4 
 
 		 476 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  28.96 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5343  hypothetical protein  28.06 
 
 		 452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000704109  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.39 
 
 		 451 aa  134  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  25.73 
 
 		 466 aa  133  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 476 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  26.96 
 
 		 459 aa  130  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  26.81 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  25.22 
 
 		 449 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  27.62 
 
 		 452 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2880  hypothetical protein  28.54 
 
 		 456 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 475 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  23.96 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2351  hypothetical protein  25.74 
 
 		 454 aa  103  9e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.446812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2670  RagB/SusD domain protein  25.1 
 
 		 484 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0022001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  26.16 
 
 		 454 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4672  RagB/SusD domain-containing protein  24.74 
 
 		 440 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.719003  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 479 aa  77.4  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.58 
 
 		 469 aa  73.6  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0306  hypothetical protein  25.12 
 
 		 481 aa  71.6  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496684  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  23.9 
 
 		 497 aa  67.4  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  24.91 
 
 		 486 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2893  hypothetical protein  25.36 
 
 		 492 aa  65.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0281285  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  26.08 
 
 		 484 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 462 aa  64.7  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  30.38 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  25.68 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  25.91 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  24.21 
 
 		 456 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  24.05 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  24.54 
 
 		 456 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1844  RagB/SusD domain protein  27.47 
 
 		 601 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 483 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  24.92 
 
 		 574 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.74 
 
 		 507 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 491 aa  54.3  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  22.9 
 
 		 478 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 500 aa  53.5  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  22.15 
 
 		 447 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  24.07 
 
 		 493 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  25.91 
 
 		 464 aa  53.1  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  24.17 
 
 		 595 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  27.78 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 500 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  25.47 
 
 		 471 aa  51.2  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 510 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  23.48 
 
 		 493 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0268  RagB/SusD domain protein  27.57 
 
 		 502 aa  50.1  0.00009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.223566  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  26.97 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  26.03 
 
 		 488 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.5 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.34 
 
 		 511 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  21.99 
 
 		 540 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  20.82 
 
 		 480 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1790  RagB/SusD domain protein  22.28 
 
 		 528 aa  47.4  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.79 
 
 		 469 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  24.18 
 
 		 467 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  22.61 
 
 		 487 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  20.83 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  23.56 
 
 		 577 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  22.87 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 538 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2192  hypothetical protein  27.59 
 
 		 484 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00226108  hitchhiker  0.00000696237 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  24.02 
 
 		 464 aa  44.7  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1735  hypothetical protein  25.26 
 
 		 482 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00608249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  25.33 
 
 		 624 aa  44.3  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  21.86 
 
 		 504 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  23.68 
 
 		 539 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  23.11 
 
 		 458 aa  43.9  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5561  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 452 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0500213 
 
 
-
 
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  24.27 
 
 		 501 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 507 aa  43.5  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  23.02 
 
 		 601 aa  43.5  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  21.55 
 
 		 478 aa  43.1  0.009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  20.61 
 
 		 493 aa  43.1  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>