120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1790 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1790  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 528 aa  1105    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  24.77 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  23.54 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  22.93 
 
 		 479 aa  69.7  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  25.52 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  26.28 
 
 		 494 aa  68.2  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  22.06 
 
 		 486 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  23.82 
 
 		 499 aa  66.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  22.24 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  25.12 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 494 aa  65.1  0.000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  22.83 
 
 		 453 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  22.43 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  27.54 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  23.38 
 
 		 456 aa  63.9  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  23.74 
 
 		 494 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  21.89 
 
 		 519 aa  60.8  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  20.63 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  21.6 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  25.89 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1379  RagB/SusD domain protein  20.61 
 
 		 574 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.390197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  22.02 
 
 		 531 aa  60.5  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3557  RagB/SusD domain-containing protein  23.59 
 
 		 467 aa  59.7  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.927903  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 456 aa  59.7  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  22.86 
 
 		 483 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 497 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  26.34 
 
 		 459 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 494 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 491 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  23.13 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  22.91 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  24.41 
 
 		 504 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 500 aa  58.2  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 594 aa  57  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  21.3 
 
 		 486 aa  57  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  23.27 
 
 		 472 aa  57  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  23.63 
 
 		 483 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4105  RagB/SusD domain protein  23.6 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  24.25 
 
 		 447 aa  56.6  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  21.77 
 
 		 491 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  23.98 
 
 		 592 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  22.63 
 
 		 461 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.9 
 
 		 549 aa  55.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  22.91 
 
 		 490 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.51 
 
 		 540 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 540 aa  54.3  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 473 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3147  RagB/SusD domain protein  23.94 
 
 		 482 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  22.93 
 
 		 557 aa  53.9  0.000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 493 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  22.58 
 
 		 492 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  24.26 
 
 		 450 aa  52.8  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 477 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  24.32 
 
 		 480 aa  53.5  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  23.01 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 491 aa  52.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  23.78 
 
 		 477 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  23.15 
 
 		 531 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2218  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 566 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.149303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 574 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  24.01 
 
 		 612 aa  51.2  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  20.52 
 
 		 464 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2009  hypothetical protein  22.28 
 
 		 467 aa  51.2  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  26.2 
 
 		 557 aa  50.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 457 aa  50.8  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  22.55 
 
 		 506 aa  50.4  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  24.68 
 
 		 541 aa  50.1  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  34.38 
 
 		 466 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  26.15 
 
 		 514 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  30.33 
 
 		 469 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  26.72 
 
 		 462 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0226  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 556 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.402875  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  21.36 
 
 		 498 aa  48.9  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  21.2 
 
 		 527 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 448 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  21.39 
 
 		 508 aa  48.9  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 497 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0057  RagB/SusD domain protein  34.65 
 
 		 487 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 572 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.04 
 
 		 622 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  27.42 
 
 		 510 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 451 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  24.08 
 
 		 548 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  26.35 
 
 		 507 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  22.55 
 
 		 532 aa  48.5  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  23.47 
 
 		 508 aa  48.9  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  23.3 
 
 		 490 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 592 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  23.42 
 
 		 449 aa  48.1  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6432  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 542 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.427253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3944  hypothetical protein  21.41 
 
 		 451 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 579 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  19.93 
 
 		 534 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 570 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  38.1 
 
 		 575 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  27.95 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  24.03 
 
 		 458 aa  45.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  25.82 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  23.45 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4183  RagB/SusD domain protein  34.02 
 
 		 610 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927446  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>