42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1575 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1575  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1121    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.12374  normal  0.0694567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  31.05 
 
 		 493 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6565  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0333955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1353  hypothetical protein  24.77 
 
 		 454 aa  73.9  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  25.6 
 
 		 495 aa  69.3  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.77 
 
 		 486 aa  67  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  27.34 
 
 		 492 aa  63.9  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 456 aa  63.5  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  25.58 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  25.15 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 472 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2265  hypothetical protein  24.63 
 
 		 451 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 469 aa  54.7  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1073  hypothetical protein  23.81 
 
 		 497 aa  54.7  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  25.09 
 
 		 500 aa  53.9  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1075  hypothetical protein  24.22 
 
 		 449 aa  53.5  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.338783  normal  0.0182355 
 
 
-
 
NC_002950  PG0186  lipoprotein RagB  26.46 
 
 		 501 aa  52  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.463623 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  22.84 
 
 		 466 aa  52  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1904  RagB/SusD domain protein  22.74 
 
 		 492 aa  50.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.879306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1992  hypothetical protein  24.16 
 
 		 452 aa  50.8  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.376684  hitchhiker  0.000060714 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 527 aa  50.1  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 491 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  22.63 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  24.84 
 
 		 506 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 491 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  25.22 
 
 		 478 aa  46.6  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  23.54 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  24.28 
 
 		 483 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  22.89 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.06 
 
 		 477 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 514 aa  46.2  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4496  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 456 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162209  normal  0.240118 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0952  Tetratricopeptide domain protein  22.62 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.099026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3578  RagB/SusD domain protein  24.58 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.728117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5520  RagB/SusD domain protein  23.25 
 
 		 599 aa  45.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000150302  normal  0.0291709 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2226  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 577 aa  44.7  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.854518  normal  0.137237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3995  hypothetical protein  21.96 
 
 		 459 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.470085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  23.08 
 
 		 456 aa  44.7  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 504 aa  43.5  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01950  hypothetical protein  23.15 
 
 		 447 aa  43.5  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>