240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1260 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1260  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 685 aa  1409    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296024  normal  0.398588 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4993  RagB/SusD domain protein  29.89 
 
 		 602 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00438028  normal  0.145323 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  32.11 
 
 		 555 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0440  RagB/SusD domain protein  32.05 
 
 		 561 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00952484  normal  0.789519 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  28.3 
 
 		 549 aa  95.5  3e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 548 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1498  RagB/SusD domain protein  31.2 
 
 		 533 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.855332  normal  0.354121 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1424  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 604 aa  84.3  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.560652 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  33.2 
 
 		 499 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  29.05 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  31.3 
 
 		 507 aa  78.6  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.19 
 
 		 534 aa  78.2  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  28.42 
 
 		 507 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 476 aa  77  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.22 
 
 		 494 aa  75.9  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3703  RagB/SusD domain protein  33.71 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.380041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  28.12 
 
 		 537 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2892  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 624 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  25.83 
 
 		 511 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 481 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  33.69 
 
 		 488 aa  72.8  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  28.72 
 
 		 490 aa  72  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  31.82 
 
 		 503 aa  72  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  32.21 
 
 		 494 aa  72.4  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  27.7 
 
 		 538 aa  71.6  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 511 aa  71.6  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  30.94 
 
 		 531 aa  71.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  31.84 
 
 		 480 aa  71.6  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  36.05 
 
 		 479 aa  71.2  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2532  RagB/SusD domain protein  28.78 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1472  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.105312  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  33.76 
 
 		 522 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  35.17 
 
 		 520 aa  70.5  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  33.79 
 
 		 547 aa  69.7  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 565 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  31.64 
 
 		 531 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  35.71 
 
 		 509 aa  68.6  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  28.76 
 
 		 522 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  36.59 
 
 		 498 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 594 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  37.25 
 
 		 473 aa  67.8  0.0000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  26.1 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.44 
 
 		 502 aa  67.8  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0344  RagB/SusD domain protein  32.03 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  37.98 
 
 		 491 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  31.22 
 
 		 511 aa  67.4  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4823  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 495 aa  67  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000639961  hitchhiker  0.00000000207149 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1128  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 568 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0330333 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1709  RagB/SusD domain protein  34.88 
 
 		 573 aa  67  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.131317  hitchhiker  0.00943188 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.36 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  33.52 
 
 		 514 aa  65.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2453  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00111761  normal  0.539083 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.54 
 
 		 480 aa  65.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.8 
 
 		 508 aa  65.5  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  27.92 
 
 		 483 aa  65.5  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3965  RagB/SusD domain protein  30.95 
 
 		 664 aa  65.1  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00142425  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  31.11 
 
 		 541 aa  65.1  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4254  RagB/SusD domain-containing protein  37.14 
 
 		 557 aa  65.1  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.804111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.26 
 
 		 486 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  33.87 
 
 		 466 aa  64.7  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2240  RagB/SusD domain protein  27.76 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0277051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.86 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  27.6 
 
 		 501 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  31.61 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  28 
 
 		 487 aa  63.5  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  30.95 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 506 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 493 aa  63.9  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1639  hypothetical protein  34.19 
 
 		 750 aa  63.9  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.667297  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  28.38 
 
 		 491 aa  63.5  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2529  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 579 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  33.13 
 
 		 527 aa  63.5  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  31.96 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  30.73 
 
 		 527 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  29.73 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 456 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  26.64 
 
 		 564 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  31.69 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 510 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  32.79 
 
 		 493 aa  62  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 491 aa  61.6  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1301  RagB/SusD domain protein  24.86 
 
 		 571 aa  61.6  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0026313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 523 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6147  hypothetical protein  34.81 
 
 		 459 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0103075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  27.11 
 
 		 460 aa  61.2  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  35.65 
 
 		 479 aa  60.8  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  29.63 
 
 		 502 aa  60.8  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  28.4 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.79 
 
 		 529 aa  60.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2559  RagB/SusD domain protein  27.63 
 
 		 629 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.615969  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1343  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 631 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0193776  normal  0.446946 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 448 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  31.98 
 
 		 579 aa  60.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  31.08 
 
 		 512 aa  60.5  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  29.07 
 
 		 487 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4094  RagB/SusD domain-containing protein  31.32 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00249622  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>