76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4522 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4522  putative lipoprotein  100 
 
 		 438 aa  894    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0748401  normal  0.225275 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01950  hypothetical protein  39.12 
 
 		 447 aa  258  2e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  33.26 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1703  putative lipoprotein  35.75 
 
 		 442 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  24.69 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.29 
 
 		 458 aa  62.4  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  30.43 
 
 		 469 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  27.73 
 
 		 461 aa  60.1  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  32.71 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 478 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  30.56 
 
 		 505 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1551  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 503 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.58784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  22.25 
 
 		 515 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  25.49 
 
 		 447 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  28.04 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  31.78 
 
 		 480 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4506  hypothetical protein  27.46 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  26.55 
 
 		 469 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  24.66 
 
 		 460 aa  50.8  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  30.7 
 
 		 494 aa  50.8  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  26.73 
 
 		 448 aa  50.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1778  RagB/SusD domain protein  37.76 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0496673  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  30.28 
 
 		 473 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  23.33 
 
 		 486 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4531  RagB/SusD domain protein  38.75 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.056511  normal  0.0821101 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 456 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  33.04 
 
 		 478 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  25.55 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4374  RagB/SusD domain-containing protein  27.2 
 
 		 471 aa  48.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0916382  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  26.09 
 
 		 466 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3539  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 496 aa  47.4  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.247427  normal  0.288919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  30.36 
 
 		 507 aa  47.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  32.35 
 
 		 572 aa  47  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1013  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 494 aa  47  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.164224  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 506 aa  47  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  37.18 
 
 		 493 aa  47  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2225  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 491 aa  47  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.53 
 
 		 471 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  36.84 
 
 		 472 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2603  RagB/SusD domain protein  31.53 
 
 		 497 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  30.33 
 
 		 490 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1035  hypothetical protein  36.99 
 
 		 459 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.54578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0446  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 530 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 582 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3951  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 456 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 497 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3213  RagB/SusD domain protein  35.9 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0916  hypothetical protein  32.97 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  37.78 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  35.9 
 
 		 522 aa  45.1  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  32.98 
 
 		 456 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0667  RagB/SusD domain protein  24.75 
 
 		 463 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0698299  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 494 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  32 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  36.9 
 
 		 494 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  33.78 
 
 		 498 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  27.83 
 
 		 534 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  25.23 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  30.63 
 
 		 486 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  24.42 
 
 		 476 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  37.35 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0273  RagB/SusD domain protein  32.38 
 
 		 582 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13078 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  31.51 
 
 		 466 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  28.97 
 
 		 486 aa  43.9  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  27.43 
 
 		 506 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 521 aa  43.9  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3049  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 475 aa  43.5  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.459556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  24.62 
 
 		 495 aa  43.5  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6683  RagB/SusD domain protein  35.44 
 
 		 490 aa  43.1  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.1 
 
 		 494 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  29.15 
 
 		 453 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  23.87 
 
 		 502 aa  43.1  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  31.63 
 
 		 595 aa  43.1  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>