14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0538 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0538  hypothetical protein  100 
 
 		 521 aa  1072    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1768  hypothetical protein  37.13 
 
 		 560 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143004  normal  0.714644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4223  hypothetical protein  38.19 
 
 		 542 aa  286  5e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.355656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5531  hypothetical protein  34.8 
 
 		 564 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0122802  normal  0.901162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  30.07 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  27.03 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  25.13 
 
 		 477 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2098  RagB/SusD domain protein  23.12 
 
 		 464 aa  52  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.131245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  26.49 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  31.75 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4610  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 494 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0690802  normal  0.474781 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1703  putative lipoprotein  29.79 
 
 		 442 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0197  RagB/SusD domain protein  30.3 
 
 		 595 aa  43.5  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>