19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5531 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5531  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1138    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0122802  normal  0.901162 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1768  hypothetical protein  63.12 
 
 		 560 aa  700    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143004  normal  0.714644 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4223  hypothetical protein  43.84 
 
 		 542 aa  420  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.355656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0538  hypothetical protein  34.77 
 
 		 521 aa  281  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  36.49 
 
 		 437 aa  50.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 531 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  31.94 
 
 		 494 aa  48.5  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  28.73 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  32.77 
 
 		 505 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  30.53 
 
 		 494 aa  48.1  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  27.27 
 
 		 601 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6154  RagB/SusD domain protein  28.65 
 
 		 476 aa  47.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.496977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0906  hypothetical protein  25.2 
 
 		 466 aa  47  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.766328  hitchhiker  0.000114402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6287  RagB/SusD domain protein  31.06 
 
 		 531 aa  45.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.360151 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  29.23 
 
 		 579 aa  44.7  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2152  RagB/SusD domain protein  30.84 
 
 		 582 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000171014  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  40.51 
 
 		 499 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  23.49 
 
 		 514 aa  43.9  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  30 
 
 		 548 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>