29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4223 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4223  hypothetical protein  100 
 
 		 542 aa  1096    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.355656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1768  hypothetical protein  47.8 
 
 		 560 aa  483  1e-135  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143004  normal  0.714644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5531  hypothetical protein  44.19 
 
 		 564 aa  415  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0122802  normal  0.901162 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0538  hypothetical protein  37.98 
 
 		 521 aa  298  1e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6127  putative lipoprotein  47.73 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  31.21 
 
 		 549 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3874  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 568 aa  53.9  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.483678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4817  RagB/SusD domain protein  30.2 
 
 		 564 aa  53.5  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0936776  unclonable  0.0000000000000465252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  32.46 
 
 		 505 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  33.04 
 
 		 478 aa  50.1  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  39.73 
 
 		 481 aa  49.3  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.86 
 
 		 484 aa  47.8  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  26.84 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  32.03 
 
 		 531 aa  47.4  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  37.35 
 
 		 500 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 456 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  33.33 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  36.75 
 
 		 481 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  35.62 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  31.15 
 
 		 494 aa  46.2  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  36.71 
 
 		 489 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2140  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.305226 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  35.07 
 
 		 532 aa  44.3  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  26.37 
 
 		 469 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  29.82 
 
 		 447 aa  43.9  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  23.85 
 
 		 469 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  27.56 
 
 		 483 aa  43.9  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1774  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 548 aa  43.5  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.475822  normal  0.891404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  32.5 
 
 		 448 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>