68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2690 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  100 
 
 
442 aa  902    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  28.87 
 
 
386 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  30.15 
 
 
383 aa  80.9  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  28.64 
 
 
360 aa  76.6  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  29.83 
 
 
387 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  30.29 
 
 
408 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  30.29 
 
 
380 aa  70.5  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  28.16 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  27.62 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  26.36 
 
 
374 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  26.3 
 
 
370 aa  65.1  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  25.83 
 
 
398 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  27.42 
 
 
392 aa  63.5  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  25.56 
 
 
390 aa  63.2  0.000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  29.66 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  30.67 
 
 
375 aa  60.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  26.9 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  27.14 
 
 
360 aa  60.1  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  27.91 
 
 
389 aa  60.1  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  25.3 
 
 
380 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  25.47 
 
 
380 aa  57.8  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  29.01 
 
 
375 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  25.33 
 
 
374 aa  57.8  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  51.9 
 
 
244 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  28.92 
 
 
450 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  26.01 
 
 
355 aa  56.6  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  25.42 
 
 
381 aa  56.2  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  25.71 
 
 
358 aa  55.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  24.34 
 
 
413 aa  53.9  0.000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  26.7 
 
 
353 aa  53.1  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  26.75 
 
 
377 aa  52.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  26.58 
 
 
369 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  42.86 
 
 
603 aa  52  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  25.32 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  23.03 
 
 
387 aa  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  24.16 
 
 
374 aa  52.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  27.27 
 
 
384 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  27.43 
 
 
404 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  26.99 
 
 
371 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  26.03 
 
 
409 aa  51.2  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  25.84 
 
 
387 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  26.9 
 
 
372 aa  49.7  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  26.99 
 
 
394 aa  50.1  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  21.43 
 
 
364 aa  50.1  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  26.99 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  32.5 
 
 
288 aa  49.3  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4923  Polyprenyl synthetase  30.3 
 
 
768 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0645809  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  26.24 
 
 
359 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  27.05 
 
 
390 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  27.18 
 
 
403 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  26.19 
 
 
360 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  21.27 
 
 
364 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  26.53 
 
 
368 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  19.14 
 
 
364 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  25 
 
 
412 aa  46.6  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  23.08 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  26.4 
 
 
355 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  34.25 
 
 
362 aa  44.3  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  23.44 
 
 
352 aa  44.3  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  30.21 
 
 
346 aa  44.7  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  27.32 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  26.81 
 
 
362 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  22.5 
 
 
356 aa  43.9  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05905  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 
467 aa  43.9  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  36.46 
 
 
1973 aa  43.5  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  20.63 
 
 
359 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0850  hypothetical protein  32.1 
 
 
1183 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  21.83 
 
 
392 aa  43.1  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>