97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2208 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  89.87 
 
 		 375 aa  664    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  100 
 
 		 375 aa  753    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  61.87 
 
 		 389 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  52.82 
 
 		 376 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  53.48 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  49.6 
 
 		 374 aa  365  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  47.59 
 
 		 387 aa  343  2e-93  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  42.59 
 
 		 383 aa  329  4e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  48.51 
 
 		 413 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  44.38 
 
 		 384 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  44.81 
 
 		 386 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  40.74 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  40.53 
 
 		 379 aa  272  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  44.69 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  45.66 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  45.38 
 
 		 390 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  40.12 
 
 		 355 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  41.79 
 
 		 352 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  44.61 
 
 		 370 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  40.36 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  42.77 
 
 		 378 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  40.83 
 
 		 362 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  41 
 
 		 362 aa  248  9e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  40.57 
 
 		 351 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  38.67 
 
 		 351 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  40.12 
 
 		 354 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  35.62 
 
 		 390 aa  239  8e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  41.07 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  41.28 
 
 		 358 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  40.36 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  40.36 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  40.54 
 
 		 335 aa  232  8.000000000000001e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  39.3 
 
 		 362 aa  232  8.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  37.89 
 
 		 346 aa  229  5e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  35.73 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  37.8 
 
 		 368 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  38.1 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  36.66 
 
 		 359 aa  228  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  35.14 
 
 		 416 aa  228  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  38.1 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  35.12 
 
 		 416 aa  226  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  39.83 
 
 		 364 aa  225  9e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  36.55 
 
 		 393 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  34.77 
 
 		 416 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  36.42 
 
 		 374 aa  222  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  35.39 
 
 		 425 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  40.62 
 
 		 352 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  36.31 
 
 		 395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  36.19 
 
 		 412 aa  220  3e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  38.48 
 
 		 372 aa  218  8.999999999999998e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  38.58 
 
 		 364 aa  218  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  38.71 
 
 		 362 aa  218  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  33.76 
 
 		 390 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  37.57 
 
 		 364 aa  212  7e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  32.92 
 
 		 400 aa  212  9e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  33.17 
 
 		 394 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  36.81 
 
 		 374 aa  209  6e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  37.57 
 
 		 364 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  38.48 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  32.49 
 
 		 403 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  38.19 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  37.68 
 
 		 380 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  32.11 
 
 		 404 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  37.68 
 
 		 380 aa  205  9e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  38.27 
 
 		 360 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  39.64 
 
 		 387 aa  201  9.999999999999999e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  37.58 
 
 		 374 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  36.65 
 
 		 386 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  36.19 
 
 		 400 aa  193  4e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  37.85 
 
 		 380 aa  192  6e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  37.85 
 
 		 408 aa  192  8e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  34.46 
 
 		 389 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  34.65 
 
 		 367 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  36.04 
 
 		 513 aa  187  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  35.73 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  35.14 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  32.66 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  27.6 
 
 		 450 aa  176  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  32.67 
 
 		 375 aa  172  9e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  26.88 
 
 		 374 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  31.25 
 
 		 360 aa  169  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  26.34 
 
 		 374 aa  166  5e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  28.92 
 
 		 373 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  29.55 
 
 		 663 aa  139  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  25.92 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  23.06 
 
 		 550 aa  97.4  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  29.52 
 
 		 355 aa  97.4  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  29.84 
 
 		 341 aa  92.8  8e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  28.71 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00839  hypothetical protein  27.75 
 
 		 447 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  29.01 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0323  hypothetical protein  25.22 
 
 		 385 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07235  conserved hypothetical protein  26.63 
 
 		 380 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.231285  normal  0.499497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5452  secreted hydrolase-like protein  28.32 
 
 		 264 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.275978 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09484  hypothetical protein  24.4 
 
 		 554 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.747805  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09234  conserved hypothetical protein  24.86 
 
 		 347 aa  45.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0868  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 606 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>