98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2019 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  89.87 
 
 
375 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  754    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  61.6 
 
 
389 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  52.01 
 
 
376 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  53.21 
 
 
387 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  49.87 
 
 
374 aa  372  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  47.31 
 
 
387 aa  339  5e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  50.14 
 
 
413 aa  330  3e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  46.31 
 
 
383 aa  328  1.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  41.8 
 
 
381 aa  291  9e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  45.87 
 
 
384 aa  288  1e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  44.41 
 
 
386 aa  283  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  40.26 
 
 
379 aa  272  7e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  41.54 
 
 
362 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  40.42 
 
 
355 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  40.75 
 
 
362 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  43.93 
 
 
370 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  41.25 
 
 
361 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  44.1 
 
 
398 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  42.17 
 
 
378 aa  250  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  44.38 
 
 
390 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  43.82 
 
 
392 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  41.14 
 
 
352 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  39.26 
 
 
362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  40.41 
 
 
354 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  40.54 
 
 
351 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  40.48 
 
 
350 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  40.83 
 
 
356 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  40.41 
 
 
351 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  38.89 
 
 
346 aa  236  7e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  40.98 
 
 
358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  37.31 
 
 
369 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  37.8 
 
 
359 aa  229  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  38.39 
 
 
353 aa  229  8e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  37.8 
 
 
368 aa  228  1e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  36.67 
 
 
374 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  35.06 
 
 
390 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  38.92 
 
 
360 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  34.38 
 
 
359 aa  225  8e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  40.54 
 
 
352 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  38.87 
 
 
362 aa  224  1e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  40.24 
 
 
335 aa  224  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  38.86 
 
 
364 aa  224  2e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  34.32 
 
 
416 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  36.01 
 
 
395 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  35.12 
 
 
416 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  38.18 
 
 
364 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  35.77 
 
 
393 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  34.5 
 
 
416 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  35.64 
 
 
412 aa  218  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  34.26 
 
 
390 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  34.83 
 
 
425 aa  216  7e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  37.68 
 
 
374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  33.17 
 
 
394 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  37.18 
 
 
372 aa  212  1e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  39.83 
 
 
409 aa  208  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  38.68 
 
 
380 aa  208  1e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  32.43 
 
 
400 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  37.09 
 
 
364 aa  207  2e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  38.68 
 
 
380 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  36.8 
 
 
364 aa  206  4e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  38.07 
 
 
360 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  38.22 
 
 
377 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  36.45 
 
 
403 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  34.66 
 
 
404 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  39.1 
 
 
387 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  36.1 
 
 
374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  36.19 
 
 
400 aa  196  7e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  36.34 
 
 
386 aa  193  4e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  37.16 
 
 
513 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  35 
 
 
389 aa  191  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  34.65 
 
 
367 aa  188  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  35.76 
 
 
371 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  36.73 
 
 
380 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  36.73 
 
 
408 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  34.4 
 
 
384 aa  186  6e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  36.06 
 
 
392 aa  186  8e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  27.61 
 
 
374 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  27.75 
 
 
450 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  26.4 
 
 
374 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  28.42 
 
 
373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  33.04 
 
 
360 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  32.54 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  30.05 
 
 
663 aa  143  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  27.19 
 
 
372 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  22.77 
 
 
550 aa  99.4  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  29.21 
 
 
355 aa  93.6  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  30.16 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  31.12 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  30.67 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0323  hypothetical protein  27.23 
 
 
385 aa  60.1  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00839  hypothetical protein  25.14 
 
 
447 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5452  secreted hydrolase-like protein  27.5 
 
 
264 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.275978 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09234  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 
347 aa  46.2  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2888  hypothetical protein  24.31 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.179405  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2608  hypothetical protein  22.87 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150006  normal  0.221999 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09484  hypothetical protein  24.85 
 
 
554 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.747805  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07235  conserved hypothetical protein  35 
 
 
380 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.231285  normal  0.499497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>