92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1286 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  100 
 
 
377 aa  749    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  65.27 
 
 
380 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  66.41 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  65.36 
 
 
374 aa  447  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  59.47 
 
 
364 aa  421  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  64.35 
 
 
358 aa  418  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  60.34 
 
 
372 aa  413  1e-114  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  53.03 
 
 
392 aa  365  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  58.74 
 
 
374 aa  366  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  53.26 
 
 
409 aa  343  4e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  48.62 
 
 
389 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  48.14 
 
 
367 aa  300  4e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  47.38 
 
 
386 aa  300  4e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  46.28 
 
 
513 aa  297  2e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  45.85 
 
 
408 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  45.85 
 
 
380 aa  278  1e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  46.86 
 
 
387 aa  278  2e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  36.67 
 
 
378 aa  205  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  37.61 
 
 
384 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  37.16 
 
 
375 aa  200  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  37.2 
 
 
375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  36.97 
 
 
389 aa  195  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  34.68 
 
 
376 aa  193  3e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  39.24 
 
 
413 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  37.01 
 
 
387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  35.16 
 
 
383 aa  189  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  33.07 
 
 
374 aa  180  4e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  33.24 
 
 
387 aa  172  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  34.01 
 
 
362 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  34.2 
 
 
386 aa  169  5e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  36.49 
 
 
370 aa  168  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  33.72 
 
 
362 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  34.86 
 
 
392 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  36.86 
 
 
352 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  34.86 
 
 
398 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  36.99 
 
 
351 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  33.24 
 
 
425 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  35.13 
 
 
354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  33.7 
 
 
355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  35.86 
 
 
364 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  34.79 
 
 
356 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  35.69 
 
 
352 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  35.86 
 
 
350 aa  161  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  32.4 
 
 
416 aa  161  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  35.16 
 
 
390 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  33.24 
 
 
361 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  35.84 
 
 
351 aa  160  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  35.53 
 
 
364 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  34.48 
 
 
346 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  34.59 
 
 
381 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  35.55 
 
 
364 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  32.5 
 
 
416 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  31.38 
 
 
403 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  31.12 
 
 
353 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  32.38 
 
 
359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  29.09 
 
 
390 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  31.94 
 
 
416 aa  153  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  31.69 
 
 
395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  32.76 
 
 
360 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  32.46 
 
 
359 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  33.62 
 
 
360 aa  149  9e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  32.49 
 
 
368 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  30.3 
 
 
394 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  31.81 
 
 
362 aa  147  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  35.16 
 
 
335 aa  145  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  30.18 
 
 
390 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  28.13 
 
 
450 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  29.73 
 
 
400 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  30.99 
 
 
379 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  29.27 
 
 
412 aa  140  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  29.06 
 
 
404 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  28.82 
 
 
369 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  29.97 
 
 
374 aa  136  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  31.03 
 
 
362 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  29.46 
 
 
400 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  30.29 
 
 
393 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  28.14 
 
 
375 aa  127  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  28.9 
 
 
374 aa  125  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  28.33 
 
 
371 aa  124  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  27.17 
 
 
374 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  28.12 
 
 
373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  30.75 
 
 
360 aa  109  9.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  26.92 
 
 
384 aa  102  8e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  24.36 
 
 
663 aa  89.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  26.88 
 
 
372 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  25.53 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  24.6 
 
 
341 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  26.74 
 
 
360 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  26.75 
 
 
442 aa  52.8  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  21.35 
 
 
550 aa  46.6  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05905  conserved hypothetical protein  25.43 
 
 
467 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2608  hypothetical protein  25 
 
 
468 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150006  normal  0.221999 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>