90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1580 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  100 
 
 
375 aa  776    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  33.68 
 
 
369 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  36.06 
 
 
368 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  34.61 
 
 
390 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  36.05 
 
 
403 aa  210  4e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  34.63 
 
 
374 aa  206  5e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  35.08 
 
 
404 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  32.44 
 
 
416 aa  205  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  35.01 
 
 
400 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  35.45 
 
 
390 aa  205  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  34.34 
 
 
393 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  34.93 
 
 
394 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  37.39 
 
 
359 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  36.76 
 
 
356 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  31.71 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  35.37 
 
 
360 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  35.55 
 
 
353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  33.93 
 
 
395 aa  199  6e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  31.22 
 
 
416 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  32.7 
 
 
412 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  35.09 
 
 
346 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  37.73 
 
 
355 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  34.65 
 
 
425 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  33.6 
 
 
359 aa  192  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  34.53 
 
 
364 aa  192  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  33.61 
 
 
351 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  34.29 
 
 
362 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  32.5 
 
 
364 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  33.42 
 
 
354 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  33.24 
 
 
352 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  31.88 
 
 
400 aa  182  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  35.48 
 
 
335 aa  182  6e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  33.24 
 
 
351 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  32.41 
 
 
350 aa  182  8.000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  31.39 
 
 
364 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  33.53 
 
 
361 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  33.72 
 
 
362 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  31.33 
 
 
362 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  34.44 
 
 
362 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  31.83 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  31.88 
 
 
413 aa  173  5e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  29.47 
 
 
374 aa  172  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  32.67 
 
 
375 aa  168  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  29.95 
 
 
384 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  31.98 
 
 
450 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  32.39 
 
 
387 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  28.13 
 
 
374 aa  164  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  32.54 
 
 
375 aa  161  2e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  28.88 
 
 
360 aa  159  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  28.84 
 
 
373 aa  158  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  29.38 
 
 
374 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  29.44 
 
 
389 aa  151  2e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  30.11 
 
 
376 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  30.14 
 
 
383 aa  142  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  30.61 
 
 
384 aa  142  9e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  30.46 
 
 
381 aa  142  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  32.35 
 
 
387 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  29.57 
 
 
370 aa  136  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  30.92 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  29.75 
 
 
386 aa  134  3e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  31.79 
 
 
390 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  27.94 
 
 
358 aa  132  7.999999999999999e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  30.64 
 
 
398 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  30.75 
 
 
378 aa  129  9.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  27.14 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  27.41 
 
 
372 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  26.63 
 
 
386 aa  126  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  27.98 
 
 
377 aa  126  5e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  26.96 
 
 
364 aa  123  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  26.55 
 
 
380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  26.55 
 
 
408 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  28.93 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  26.84 
 
 
374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  28.65 
 
 
380 aa  116  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  29.19 
 
 
387 aa  115  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  27.89 
 
 
513 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  24.28 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  28.08 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  26.1 
 
 
374 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  27.14 
 
 
389 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  25.76 
 
 
392 aa  105  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  25.77 
 
 
367 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  28.44 
 
 
371 aa  95.9  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  25.95 
 
 
663 aa  86.3  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  24.93 
 
 
379 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  24.52 
 
 
341 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  24 
 
 
355 aa  63.2  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  23.3 
 
 
360 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  23.37 
 
 
550 aa  51.2  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2888  hypothetical protein  27.64 
 
 
375 aa  45.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.179405  normal  0.172957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>