16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2608 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2608  hypothetical protein  100 
 
 		 468 aa  969    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.150006  normal  0.221999 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  27.6 
 
 		 386 aa  55.1  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  25.38 
 
 		 392 aa  55.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  24.48 
 
 		 364 aa  48.9  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  24.41 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  24.61 
 
 		 374 aa  48.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  21.4 
 
 		 387 aa  47  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  24.51 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  24.51 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  24.34 
 
 		 380 aa  45.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  22.87 
 
 		 375 aa  45.1  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  36.67 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  25.63 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  23.88 
 
 		 377 aa  44.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  24.34 
 
 		 408 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  22.11 
 
 		 358 aa  44.7  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>