91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0831 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  93.73 
 
 
394 aa  776    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  100 
 
 
400 aa  830    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  96.04 
 
 
404 aa  802    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  93.75 
 
 
390 aa  776    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  73.87 
 
 
403 aa  615  1e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  66.83 
 
 
416 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  67.58 
 
 
416 aa  533  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  66.42 
 
 
416 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  67.59 
 
 
425 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  55.45 
 
 
412 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  56.54 
 
 
368 aa  427  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  56.82 
 
 
395 aa  420  1e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  50.25 
 
 
390 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  50.74 
 
 
393 aa  404  1e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  48.75 
 
 
369 aa  389  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  50 
 
 
374 aa  382  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  47.88 
 
 
400 aa  342  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  40.97 
 
 
346 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  40.44 
 
 
362 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  40.1 
 
 
359 aa  270  5e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  39.69 
 
 
355 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  40.45 
 
 
361 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  40.56 
 
 
362 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  39.06 
 
 
353 aa  261  2e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  39.24 
 
 
356 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  40.87 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  39.72 
 
 
350 aa  250  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  38.97 
 
 
364 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  40 
 
 
354 aa  250  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  39.61 
 
 
360 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  39.06 
 
 
352 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  38.07 
 
 
359 aa  246  6.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  39.53 
 
 
364 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  36.17 
 
 
362 aa  239  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  30.97 
 
 
450 aa  238  1e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  38.95 
 
 
364 aa  238  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  37.05 
 
 
362 aa  236  4e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  37.47 
 
 
351 aa  232  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  37.08 
 
 
351 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  38.35 
 
 
352 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  35.37 
 
 
360 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  34.41 
 
 
387 aa  218  2e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  33 
 
 
376 aa  213  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  32.92 
 
 
375 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  32.43 
 
 
375 aa  207  3e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  35.14 
 
 
384 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  35.01 
 
 
375 aa  204  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  30.96 
 
 
373 aa  199  7.999999999999999e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  32.6 
 
 
389 aa  193  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  32.35 
 
 
383 aa  192  7e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  31.58 
 
 
413 aa  192  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  34.1 
 
 
374 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  31.65 
 
 
384 aa  186  6e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  29.93 
 
 
387 aa  186  6e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  27.18 
 
 
374 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  30.08 
 
 
374 aa  182  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  30.56 
 
 
381 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  35.64 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  31.98 
 
 
370 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  32.98 
 
 
390 aa  163  6e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  32.96 
 
 
386 aa  162  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  33.33 
 
 
392 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  33.42 
 
 
398 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  32.31 
 
 
386 aa  154  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  34.51 
 
 
513 aa  155  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  27.89 
 
 
372 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  33.51 
 
 
389 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  31.55 
 
 
387 aa  152  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  34.05 
 
 
367 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  30.77 
 
 
364 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  30.94 
 
 
408 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  30.83 
 
 
380 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  31.42 
 
 
374 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  30.56 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  29.28 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  30.6 
 
 
379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  30.03 
 
 
377 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  28.65 
 
 
358 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  27.81 
 
 
380 aa  126  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  27.35 
 
 
380 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  29.34 
 
 
392 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  26.65 
 
 
374 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  28.17 
 
 
360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  24.64 
 
 
371 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  24.3 
 
 
663 aa  81.6  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  25.14 
 
 
355 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  26.19 
 
 
360 aa  56.6  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  26.52 
 
 
341 aa  54.7  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  26.99 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  19.66 
 
 
550 aa  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0923  hypothetical protein  26.32 
 
 
474 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.946452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>