91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3203 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  843    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  55.83 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  55.5 
 
 		 425 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  54.68 
 
 		 404 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  56.1 
 
 		 416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  53.48 
 
 		 394 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  55.61 
 
 		 416 aa  448  1e-125  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  54.03 
 
 		 400 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  54.07 
 
 		 390 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  53.52 
 
 		 416 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  58.61 
 
 		 368 aa  444  1e-123  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  52.4 
 
 		 403 aa  435  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  52.05 
 
 		 393 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  52.26 
 
 		 369 aa  420  1e-116  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  51.15 
 
 		 374 aa  404  1e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  54.82 
 
 		 395 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  49.62 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  38.92 
 
 		 355 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  39.65 
 
 		 362 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  39.55 
 
 		 346 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  38.4 
 
 		 353 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  40.33 
 
 		 335 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  39.78 
 
 		 362 aa  262  8.999999999999999e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  38.8 
 
 		 361 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  37.89 
 
 		 359 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  40.06 
 
 		 360 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  38.34 
 
 		 350 aa  251  2e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  37.09 
 
 		 359 aa  249  9e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  36.61 
 
 		 362 aa  247  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  38.42 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  36.32 
 
 		 356 aa  242  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  36.61 
 
 		 364 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  37.13 
 
 		 354 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  39.21 
 
 		 360 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  37.18 
 
 		 352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  34.8 
 
 		 387 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  35.14 
 
 		 364 aa  230  4e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  31.55 
 
 		 450 aa  230  4e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  34.89 
 
 		 364 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  35.13 
 
 		 351 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  35.26 
 
 		 351 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  34.79 
 
 		 352 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  32.71 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  32.04 
 
 		 376 aa  219  7.999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  33.79 
 
 		 373 aa  216  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  34.46 
 
 		 375 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  33.89 
 
 		 413 aa  212  9e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  33.24 
 
 		 383 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  33.49 
 
 		 375 aa  211  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  34.32 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  33.5 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  32.34 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  32.43 
 
 		 375 aa  199  9e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  33.5 
 
 		 374 aa  196  9e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  30.68 
 
 		 374 aa  192  7e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  27.76 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  31.33 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  33.95 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  35.16 
 
 		 378 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  27.67 
 
 		 372 aa  169  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  32.44 
 
 		 370 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  35.09 
 
 		 392 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  32.63 
 
 		 390 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  29.17 
 
 		 408 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  30.35 
 
 		 380 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  33.95 
 
 		 398 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  27.9 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  32.27 
 
 		 389 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  30.62 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  30.03 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  29.27 
 
 		 364 aa  142  8e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  29.2 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  29.27 
 
 		 377 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  29.49 
 
 		 372 aa  139  8.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  28.34 
 
 		 358 aa  138  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  31.4 
 
 		 367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  30.89 
 
 		 513 aa  134  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  27.72 
 
 		 380 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  28.65 
 
 		 360 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  26.49 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  27.23 
 
 		 374 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  27.61 
 
 		 409 aa  116  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  27.66 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  27.86 
 
 		 371 aa  113  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  25.95 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  21.79 
 
 		 663 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  30.64 
 
 		 341 aa  66.2  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  27.47 
 
 		 360 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  22.9 
 
 		 550 aa  54.7  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  25 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2888  hypothetical protein  29.89 
 
 		 375 aa  43.9  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.179405  normal  0.172957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>