35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2888 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_2888  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  783    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.179405  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  28.49 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  25.08 
 
 
356 aa  50.4  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  28.14 
 
 
384 aa  49.7  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  27.84 
 
 
360 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  25.32 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  25.2 
 
 
408 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  24.44 
 
 
354 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  25.2 
 
 
380 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  28.1 
 
 
398 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  27.32 
 
 
376 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  23.64 
 
 
355 aa  47  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  25.22 
 
 
359 aa  47  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  27.45 
 
 
392 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  28.28 
 
 
351 aa  47  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  25.75 
 
 
389 aa  46.6  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  20.69 
 
 
663 aa  46.6  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  23.51 
 
 
387 aa  46.2  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  28.1 
 
 
390 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  28.37 
 
 
381 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  26.16 
 
 
383 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  27.64 
 
 
375 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  27.78 
 
 
513 aa  45.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  32.91 
 
 
335 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1588  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.23 
 
 
1067 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  23.18 
 
 
353 aa  45.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  24.2 
 
 
387 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  28.57 
 
 
351 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  23.86 
 
 
375 aa  43.9  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  23.45 
 
 
359 aa  43.9  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  28.57 
 
 
352 aa  43.9  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  22.22 
 
 
372 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  29.89 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  24.26 
 
 
369 aa  43.1  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  24.22 
 
 
384 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>