88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1176 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  100 
 
 		 355 aa  723    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  57.93 
 
 		 341 aa  391  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  30.94 
 
 		 360 aa  120  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  30.39 
 
 		 408 aa  105  9e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  31.05 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  30.89 
 
 		 387 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  33.44 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  33.55 
 
 		 392 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  31.46 
 
 		 376 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  30.55 
 
 		 370 aa  97.4  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  29.52 
 
 		 375 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  29.72 
 
 		 374 aa  96.7  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  32.6 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  30.72 
 
 		 355 aa  94  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  28.52 
 
 		 387 aa  93.6  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  29.02 
 
 		 371 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  29.21 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  30.58 
 
 		 389 aa  92  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  30.03 
 
 		 381 aa  89.7  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  27.63 
 
 		 513 aa  89  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  28.48 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  27.75 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  29.14 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  28.44 
 
 		 409 aa  86.3  7e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  29.28 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  26.79 
 
 		 386 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  28.57 
 
 		 378 aa  82.8  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  26.92 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  27.75 
 
 		 360 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  30.41 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  25.53 
 
 		 377 aa  80.1  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  28.06 
 
 		 380 aa  79.7  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  28 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  28.31 
 
 		 352 aa  79.7  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  26.88 
 
 		 389 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  27.36 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  28.39 
 
 		 380 aa  79.3  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  26.35 
 
 		 372 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  26.83 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  28.43 
 
 		 352 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  28.7 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  27.46 
 
 		 362 aa  77.8  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  27.01 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  27.33 
 
 		 362 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  26.48 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  25.94 
 
 		 364 aa  75.9  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  25.76 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  26.37 
 
 		 335 aa  75.5  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  28.8 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  27.58 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  28.66 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  26.17 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  25.95 
 
 		 412 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  26.92 
 
 		 353 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  26.85 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  25.94 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  24.24 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  25 
 
 		 390 aa  69.7  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  26.75 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  25.56 
 
 		 364 aa  69.3  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  25.63 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  23.23 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  23.48 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  24.72 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  24.7 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  28.16 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  26.42 
 
 		 346 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  25.14 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  26.35 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  25.08 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  24.4 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  20.8 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  23.42 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  25.58 
 
 		 386 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  25.08 
 
 		 350 aa  64.7  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  22.4 
 
 		 368 aa  63.2  0.000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  25.75 
 
 		 354 aa  62.8  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  24.6 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  24.93 
 
 		 400 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  23.38 
 
 		 375 aa  62.4  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  22.6 
 
 		 393 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  25.62 
 
 		 359 aa  57.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  23.58 
 
 		 663 aa  54.7  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  28.47 
 
 		 374 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2888  hypothetical protein  23.64 
 
 		 375 aa  47  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.179405  normal  0.172957 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  23.81 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  26.4 
 
 		 442 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  24.14 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>