90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4108 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  100 
 
 		 390 aa  806    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  56.7 
 
 		 393 aa  450  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  60.98 
 
 		 368 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  56.84 
 
 		 412 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  53.37 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  52.39 
 
 		 416 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  52.39 
 
 		 416 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  52.11 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  50.64 
 
 		 394 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  51.27 
 
 		 416 aa  409  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  49.25 
 
 		 404 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  50.25 
 
 		 400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  50.64 
 
 		 390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  49.15 
 
 		 425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  49.34 
 
 		 369 aa  395  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  51.37 
 
 		 374 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  46.55 
 
 		 400 aa  329  7e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  45.92 
 
 		 335 aa  286  5.999999999999999e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  43.36 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  42.86 
 
 		 364 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  40.26 
 
 		 356 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  42.11 
 
 		 353 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  42.01 
 
 		 355 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  42.06 
 
 		 362 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  41.47 
 
 		 362 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  42.06 
 
 		 346 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  41.95 
 
 		 350 aa  262  8.999999999999999e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  42.48 
 
 		 360 aa  262  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  38.28 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  37.73 
 
 		 364 aa  259  7e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  39.82 
 
 		 361 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  37.53 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  35.77 
 
 		 376 aa  243  5e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  40.3 
 
 		 354 aa  239  6.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  37.4 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  40.41 
 
 		 352 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  36.25 
 
 		 387 aa  236  7e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  35.62 
 
 		 375 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  39.12 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  36.08 
 
 		 362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  40.12 
 
 		 351 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  37.63 
 
 		 351 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  36.39 
 
 		 413 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  40.3 
 
 		 352 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  30.6 
 
 		 450 aa  226  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  35.06 
 
 		 375 aa  224  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 384 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  34.52 
 
 		 374 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2025  membrane protein  32.56 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  32.96 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  34.02 
 
 		 389 aa  213  5.999999999999999e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  30.91 
 
 		 374 aa  212  7.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  36.05 
 
 		 384 aa  211  2e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  33.68 
 
 		 374 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  35.33 
 
 		 375 aa  204  3e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  33.25 
 
 		 387 aa  202  8e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  35.81 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  31.38 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  36.81 
 
 		 392 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  35.83 
 
 		 378 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  35.89 
 
 		 398 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  34.08 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  33.79 
 
 		 386 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  35.23 
 
 		 389 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  33.43 
 
 		 386 aa  172  9e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  31.56 
 
 		 358 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1234  hypothetical protein  30.32 
 
 		 372 aa  169  6e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000051189  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  33.99 
 
 		 513 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2048  hypothetical protein  31.01 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.356094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  30.54 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  30.97 
 
 		 364 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  31.44 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  32.01 
 
 		 367 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  30.88 
 
 		 372 aa  153  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  29.09 
 
 		 377 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  31.18 
 
 		 409 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3116  secreted hydrolase-like protein  27.37 
 
 		 380 aa  149  7e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.877077 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2462  secreted hydrolase-like protein  27.09 
 
 		 380 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.249104  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0803  hypothetical protein  29.41 
 
 		 380 aa  146  6e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0653  hypothetical protein  29.41 
 
 		 408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  28.38 
 
 		 392 aa  134  3e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  26.92 
 
 		 360 aa  133  6.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5157  secreted hydrolase-like protein  28.45 
 
 		 374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  24.72 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1599  secreted hydrolase-like protein  22.51 
 
 		 663 aa  87.8  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000036978  normal  0.453344 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  23 
 
 		 550 aa  73.2  0.000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1176  hypothetical protein  24.24 
 
 		 355 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000944356  normal  0.803843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4472  secreted hydrolase-like protein  29.51 
 
 		 360 aa  66.2  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.214249  normal  0.243711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1886  Protein of unknown function DUF2006  23.62 
 
 		 341 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0752233  normal  0.497381 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4188  hypothetical protein  22.11 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000111966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>