77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0983 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0983  prefoldin molecular chaperone  100 
 
 
550 aa  1140    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.415206  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0065  secreted hydrolase-like protein  25.25 
 
 
376 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1415  hypothetical protein  27.18 
 
 
387 aa  94  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.541755  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2019  hypothetical protein  23.02 
 
 
375 aa  94  7e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000706045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2208  hypothetical protein  23.06 
 
 
375 aa  92.8  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.543456  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2186  hypothetical protein  24.57 
 
 
389 aa  89.7  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.34033  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0002  secreted hydrolase-like protein  23.86 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000706868  unclonable  0.000000000576659 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4754  hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  23.57 
 
 
383 aa  87.8  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.772037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3955  hypothetical protein  25.83 
 
 
393 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779914  normal  0.022032 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11006  hypothetical protein  25.54 
 
 
386 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.19907e-56  normal  0.122138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3423  hypothetical protein  22.34 
 
 
416 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0554  hypothetical protein  22.51 
 
 
395 aa  77  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.817301  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1774  hypothetical protein  23.88 
 
 
370 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.341768  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1194  hypothetical protein  23.8 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1006  hypothetical protein  23.88 
 
 
378 aa  74.3  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1313  hypothetical protein  25.09 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.447479  normal  0.673608 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1993  secreted hydrolase-like protein  27.21 
 
 
413 aa  73.2  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4108  hypothetical protein  23 
 
 
390 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0192  secreted hydrolase-like protein  23.51 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.400683  normal  0.94158 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0344  hypothetical protein  25.64 
 
 
362 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0639153  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3311  hypothetical protein  22.25 
 
 
416 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4398  hypothetical protein  22.88 
 
 
362 aa  67.8  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117298  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0711  hypothetical protein  21.55 
 
 
416 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2028  hypothetical protein  22.39 
 
 
355 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1636  hypothetical protein  23.81 
 
 
353 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001048  hypothetical protein  23.89 
 
 
374 aa  65.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5298  hypothetical protein  22.34 
 
 
361 aa  65.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0311  hypothetical protein  22.57 
 
 
360 aa  65.1  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0855  hypothetical protein  22.97 
 
 
425 aa  64.3  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3480  secreted hydrolase-like protein  21.57 
 
 
358 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6017  hypothetical protein  22.46 
 
 
356 aa  64.3  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3745  hypothetical protein  21.98 
 
 
359 aa  63.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.114151  normal  0.0295635 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04770  hydrolase  23.23 
 
 
369 aa  63.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1519  putative AttH  21.66 
 
 
392 aa  63.5  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2030  secreted hydrolase-like protein  21.2 
 
 
351 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3733  ABC transporter lipoprotein, putative  20.77 
 
 
352 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142601  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2957  hypothetical protein  22.87 
 
 
400 aa  61.6  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.338576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0078  hypothetical protein  23.05 
 
 
346 aa  61.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6286  hypothetical protein  23.55 
 
 
359 aa  61.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.107341  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0625  hypothetical protein  24.32 
 
 
368 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1686  Protein of unknown function DUF2006  23.49 
 
 
384 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0684  hypothetical protein  23.66 
 
 
360 aa  61.2  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3352  hypothetical protein  22.69 
 
 
354 aa  60.1  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.779902 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1176  hypothetical protein  22.64 
 
 
335 aa  59.3  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00359132  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1279  hypothetical protein  22.88 
 
 
409 aa  59.3  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000467326 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1611  hypothetical protein  24.73 
 
 
379 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2173  putative lipoprotein  22.18 
 
 
351 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.296969  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2041  hypothetical protein  22.52 
 
 
390 aa  58.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.010776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01330  predicted secreted hydrolase  19.1 
 
 
450 aa  57.8  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.101344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003768  hypothetical protein  21.66 
 
 
374 aa  57  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3228  secreted hydrolase-like  21.45 
 
 
364 aa  57  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2642  putative lipoprotein  24.44 
 
 
384 aa  56.6  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.513743  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2668  hypothetical protein  22.99 
 
 
362 aa  56.6  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00325621  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3203  hypothetical protein  22.9 
 
 
412 aa  54.7  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2555  putative lipoprotein  20.3 
 
 
352 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02647  hydrolase  20.86 
 
 
374 aa  53.9  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1837  hypothetical protein  21.86 
 
 
398 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0255  hypothetical protein  22.87 
 
 
350 aa  53.1  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1540  secreted hydrolase  20.83 
 
 
364 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.86814  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2143  hypothetical protein  22.87 
 
 
387 aa  52.4  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4688  hypothetical protein  22.81 
 
 
362 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1922  hypothetical protein  22.08 
 
 
392 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1580  putative secreted hydrolase  23.37 
 
 
375 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125275  normal  0.120908 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0191  secreted hydrolase  20.83 
 
 
364 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212117  normal  0.791095 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3020  secreted hydrolase-like protein  21.53 
 
 
364 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0547861  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3509  hypothetical protein  21.78 
 
 
394 aa  50.8  0.00006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1458  secreted hydrolase-like protein  21.29 
 
 
372 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0893  putative AttH  24.31 
 
 
386 aa  49.7  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.27416  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3146  hypothetical protein  21.77 
 
 
403 aa  49.7  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0831  hypothetical protein  19.66 
 
 
400 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1194  hypothetical protein  20.15 
 
 
371 aa  47.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000162993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0866  hypothetical protein  19.45 
 
 
390 aa  47.4  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0854  hypothetical protein  19.59 
 
 
404 aa  47  0.0009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1642  putative AttH  20.65 
 
 
389 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384305  normal  0.0577815 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3629  putative AttH  20.95 
 
 
367 aa  45.1  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00823607  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1286  secreted hydrolase-like protein  21.64 
 
 
377 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5005  secreted hydrolase-like protein  21.14 
 
 
513 aa  44.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  hitchhiker  0.00394498 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>