15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2752 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  100 
 
 		 288 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  50.32 
 
 		 308 aa  275  9e-73  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  43.45 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  36.21 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  48.35 
 
 		 603 aa  73.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1011  hypothetical protein  30.63 
 
 		 279 aa  57.8  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  32.48 
 
 		 435 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3758  hypothetical protein  42.19 
 
 		 1074 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207079  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  33.87 
 
 		 244 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  27.01 
 
 		 476 aa  45.8  0.0009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  39.81 
 
 		 626 aa  44.3  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  25.93 
 
 		 209 aa  43.9  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  31.9 
 
 		 185 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  41.77 
 
 		 847 aa  42.7  0.008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0363  hypothetical protein  21.83 
 
 		 185 aa  42.7  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806231  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>