19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0361 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  396  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1011  hypothetical protein  51.37 
 
 
279 aa  169  2e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  43.09 
 
 
435 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  37.16 
 
 
243 aa  102  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  30.1 
 
 
209 aa  81.6  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  37.29 
 
 
288 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  29.05 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  29.19 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  30.56 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  30.56 
 
 
230 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  30.68 
 
 
185 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  28.18 
 
 
214 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  28.57 
 
 
308 aa  62.8  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  28.18 
 
 
214 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0363  hypothetical protein  23.03 
 
 
185 aa  61.2  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  28.33 
 
 
222 aa  60.5  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  25 
 
 
209 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  26.26 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1922  hypothetical protein  22.58 
 
 
213 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>