19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1924 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1924  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  867    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1011  hypothetical protein  45.22 
 
 
279 aa  172  1e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0361  hypothetical protein  43.09 
 
 
195 aa  126  9e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.793199  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1919  hypothetical protein  35.42 
 
 
209 aa  91.3  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2130  hypothetical protein  34.39 
 
 
243 aa  88.2  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00274395 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1737  hypothetical protein  33.33 
 
 
222 aa  79.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  0.958514 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2398  hypothetical protein  30.85 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.54266  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2895  hypothetical protein  30.85 
 
 
214 aa  76.3  0.0000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4256  hypothetical protein  31.22 
 
 
230 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4782  hypothetical protein  31.22 
 
 
230 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181394  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2795  hypothetical protein  29.35 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.150416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2887  hypothetical protein  30.35 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0248177  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2045  hypothetical protein  32.28 
 
 
222 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0577  hypothetical protein  26.51 
 
 
209 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  34.75 
 
 
288 aa  60.5  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2905  alpha amylase domain-containing protein  27.03 
 
 
185 aa  55.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.450058 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0363  hypothetical protein  26.09 
 
 
185 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.806231  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1922  hypothetical protein  22.99 
 
 
213 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  52.38 
 
 
308 aa  45.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>